233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2397 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  664    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  29.38 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.71 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.76 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.44 
 
 		 287 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.82 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.96 
 
 		 297 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.83 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  30.25 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.65 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  29.64 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.21 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.65 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.45 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  31.87 
 
 		 294 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.16 
 
 		 286 aa  119  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  28.7 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  29.09 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.69 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  30.97 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  24.53 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  30.67 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.64 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  27.53 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.43 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  31.45 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.66 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  29.03 
 
 		 363 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  36.02 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  32.6 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.86 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  24.82 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  41.98 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  30.33 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  26.88 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  26.87 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  26.87 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  26.2 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  26.87 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  37.14 
 
 		 318 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  37.14 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  24.6 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  36.48 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.58 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  27.23 
 
 		 345 aa  86.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  41.86 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  28.51 
 
 		 308 aa  86.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  37.68 
 
 		 322 aa  86.3  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  40 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  40 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  45.36 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  45.36 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  36.03 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  34.65 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  45.36 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  36.88 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  36.84 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  40.62 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  24.92 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  42.34 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  40.62 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  36.03 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  40.62 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  39.68 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  39.84 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  39.84 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  28.72 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  40.7 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  30.69 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  38.52 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  38.89 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  35.66 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  25.85 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  30 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  23.19 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  40.78 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  36.09 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  40.58 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  29.2 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  40.78 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  26.42 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  37.38 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  33.08 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  28.16 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  37.5 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  27.59 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  26.88 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  27.61 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  37.07 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  26.76 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  27.76 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  27.55 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  37.41 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  27.2 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  36.8 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  40.79 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  40.54 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  37.5 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  25.1 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  26.6 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>