More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2930 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  657    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  79.67 
 
 		 317 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  76.47 
 
 		 314 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  75.56 
 
 		 318 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  75.82 
 
 		 314 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  74.92 
 
 		 318 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  78.1 
 
 		 314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  77.78 
 
 		 314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  73.7 
 
 		 312 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  73.27 
 
 		 312 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  73.48 
 
 		 312 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  38.14 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  35.46 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  36.91 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  38.01 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  37.58 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  35.43 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  34.36 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  35.44 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  37.59 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  37.58 
 
 		 335 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  38.08 
 
 		 317 aa  175  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  37.11 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  34.02 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  39.16 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  37.91 
 
 		 311 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  36.54 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  39.34 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  39.85 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  41.63 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  29.61 
 
 		 345 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  39.46 
 
 		 317 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  42.11 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  34.33 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  39.27 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  32.34 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  39.67 
 
 		 324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  36.98 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  38.52 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  36.39 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  32.99 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  31.95 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  31.6 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  31.39 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  33.54 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  31.27 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  37.54 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  37.54 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  39.92 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  37.98 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  31.82 
 
 		 331 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  33.44 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  31.94 
 
 		 295 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  34.51 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  35.98 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  36.76 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  31.33 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  30.85 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  34.27 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  32.97 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  29.17 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  33.84 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  32.16 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  31.19 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.3 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  37.87 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  30.04 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  35.02 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.94 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  27.05 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  31.21 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  31.76 
 
 		 295 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.99 
 
 		 295 aa  125  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  33.93 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.57 
 
 		 291 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  42.86 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.41 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  30.16 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.74 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.97 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  32.08 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.16 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.67 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  34.51 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  31.94 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  29.72 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.09 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  25.55 
 
 		 295 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  34.77 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  35.2 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  29.13 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.95 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0789  hypothetical protein  31.45 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.025632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  32.96 
 
 		 309 aa  99.4  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  34.3 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.64 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  32.18 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  32.64 
 
 		 357 aa  96.3  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  35.02 
 
 		 331 aa  95.9  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>