More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4525 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  70.36 
 
 		 341 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  54.31 
 
 		 331 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  52.6 
 
 		 312 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  49.51 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  52.43 
 
 		 334 aa  279  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  45.39 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  45.82 
 
 		 311 aa  229  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  35.35 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  42.86 
 
 		 320 aa  198  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3219  protein of unknown function DUF58  40.8 
 
 		 331 aa  195  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000742031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  39.27 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  37.85 
 
 		 393 aa  189  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  38.28 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  38.94 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  38.44 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  38.36 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  38.03 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  35.99 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  37.17 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  34.5 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  36.39 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  39.74 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  36.58 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  36.58 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  35.6 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  38.21 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  37.54 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  37.7 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  37.31 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  37.12 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  34.21 
 
 		 319 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  33 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  40.68 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  32.42 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  36.61 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  31.23 
 
 		 323 aa  149  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  34.39 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  30.16 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  32.2 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  33.73 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  35.94 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  35.94 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  36.41 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  31.44 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  35.65 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  39.56 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  33.46 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  35.19 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  33.94 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  29.92 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  35.18 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  33.09 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  35.94 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  35.94 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  37.39 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  34.98 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  30.29 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  31.17 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  34.73 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  34.32 
 
 		 309 aa  123  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  32.4 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  32.89 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  31.08 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.51 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.47 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  29.66 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  35.12 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  33.18 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.01 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  29.24 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  30.47 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  32.38 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  35.5 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.61 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  31.79 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  29.61 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.94 
 
 		 288 aa  110  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  33.76 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.77 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  30.5 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  31.15 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  32.58 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  31.6 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.82 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.97 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.27 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  28.46 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  32.72 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  35.47 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  31.58 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  29.52 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  30.58 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  30.58 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  30.58 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  33.9 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  32.23 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  32.91 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  32.91 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  33.94 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>