92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3219 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3219  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 331 aa  663    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000742031 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  39.1 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  39.1 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  41.81 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  40.8 
 
 		 335 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  36.36 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  36.3 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  33.97 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  25.48 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  29.92 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  29.43 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  28.63 
 
 		 320 aa  95.9  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  95.9  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  31.42 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  30.67 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  27.83 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  27.51 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  27.83 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  27.83 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  27.69 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  29.1 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  26.62 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  24.92 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  29.91 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  28.38 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  24.92 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  24.92 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  25.99 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  26.43 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  27.53 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  26.47 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  27.53 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  27.84 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  27.66 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  35.25 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  33.88 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  22.55 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  31.1 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  30.35 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  24 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  24.26 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  23.93 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25.35 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  23.92 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  28.05 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  23.59 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  26.55 
 
 		 309 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  26.75 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  27.47 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  25.11 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  25.82 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  30.18 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  26.92 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  35 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  24.24 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  21.83 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  24.46 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  21.51 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25.57 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  23.93 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  28.96 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  23.7 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  23.33 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  24.08 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  26.54 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  25.5 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  23.7 
 
 		 317 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  36.14 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  23.7 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  25.84 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  25.84 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  25.84 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  26.42 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  21.18 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  29.22 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  25.86 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  26.7 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  26.7 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  25.43 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  21.35 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1384  hypothetical protein  33.1 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3276  hypothetical protein  28.77 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345093  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4009  hypothetical protein  29.27 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0352692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  32.88 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  20.12 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  20.57 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0789  hypothetical protein  35.71 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.025632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  26.63 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  26.61 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  26.34 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  22.75 
 
 		 290 aa  43.1  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  21.62 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>