202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0789 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0789  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.025632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  92.9 
 
 
309 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  92.9 
 
 
309 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4307  hypothetical protein  71.72 
 
 
297 aa  363  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0981315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  69.87 
 
 
322 aa  348  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1384  hypothetical protein  68.61 
 
 
306 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  48.12 
 
 
319 aa  238  8e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  44.05 
 
 
302 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3276  hypothetical protein  47.14 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345093  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4009  hypothetical protein  47.14 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0352692  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  32.51 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  32.24 
 
 
303 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  32.24 
 
 
303 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1126  hypothetical protein  44.22 
 
 
232 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  28.46 
 
 
308 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  32.6 
 
 
312 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  30.03 
 
 
314 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  33.14 
 
 
324 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  29.84 
 
 
314 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  32.39 
 
 
329 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  30.19 
 
 
318 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  29.87 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  29.76 
 
 
317 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  29.66 
 
 
310 aa  99.8  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  34.1 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  26.5 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  23.87 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  28.77 
 
 
323 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  32.78 
 
 
322 aa  95.9  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  32.02 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  34.58 
 
 
341 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  32.34 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.94 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  26.58 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  32.02 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  32.02 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  30.77 
 
 
345 aa  92.8  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  36.25 
 
 
312 aa  92.4  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  37.22 
 
 
334 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  32.47 
 
 
393 aa  92.4  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  30.66 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  30.77 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  31.64 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  40.19 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  41.35 
 
 
331 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  28.07 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  30.99 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  36.87 
 
 
335 aa  89.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  32.12 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  29.63 
 
 
314 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  34.56 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  36.02 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  29.3 
 
 
306 aa  85.5  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  35.1 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  32.95 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  36.48 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  31.95 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  31.28 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  30.6 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  32 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  31.21 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  31.21 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  37.23 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  34.3 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.27 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  34.88 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  26.02 
 
 
304 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  37.5 
 
 
296 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.91 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  29.41 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  25.31 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  33.17 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  36.19 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  28.39 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.75 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  32.21 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  32.12 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  27.7 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  37.68 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  23.79 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  33.96 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  32.21 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  31.03 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  29.92 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  26.87 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1735  hypothetical protein  24.83 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal  0.740515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  32.38 
 
 
287 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  31.1 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  33.08 
 
 
328 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.45 
 
 
287 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.91 
 
 
291 aa  62.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  62.8  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  31.9 
 
 
290 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  26.6 
 
 
391 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  39.25 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  50 
 
 
430 aa  60.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  36.22 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  26.76 
 
 
287 aa  60.1  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  34.44 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  31.75 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>