More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0850 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  45.69 
 
 
393 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  40 
 
 
303 aa  192  8e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  40.36 
 
 
303 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  38.17 
 
 
323 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  37.85 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  40.44 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  39.27 
 
 
329 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  31.38 
 
 
319 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  36.52 
 
 
318 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  36.18 
 
 
314 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  37.31 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  36.52 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  32.58 
 
 
351 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  35.37 
 
 
316 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  36.05 
 
 
320 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  39.84 
 
 
312 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  36.63 
 
 
317 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  37.41 
 
 
312 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  38.98 
 
 
312 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  30.67 
 
 
308 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  40.68 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  41.01 
 
 
317 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  41.01 
 
 
317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  41.01 
 
 
317 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  34.25 
 
 
310 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  39.81 
 
 
309 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  41.01 
 
 
317 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  34.1 
 
 
312 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  29.9 
 
 
304 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  30.1 
 
 
308 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  35.47 
 
 
314 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  35.47 
 
 
314 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  35.02 
 
 
322 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  41.79 
 
 
324 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  27.63 
 
 
345 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  37.42 
 
 
334 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  35.96 
 
 
331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  45.83 
 
 
317 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  37.96 
 
 
311 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  38.46 
 
 
322 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  38.72 
 
 
309 aa  142  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  38.79 
 
 
309 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  30.23 
 
 
331 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  35.46 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  30.4 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  39.63 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  30.23 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  39.63 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  45.24 
 
 
327 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  37.04 
 
 
318 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  29.57 
 
 
330 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  36.77 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  37.67 
 
 
311 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  31.86 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.46 
 
 
287 aa  132  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  34 
 
 
309 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  31.46 
 
 
336 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  29.75 
 
 
291 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  30.47 
 
 
290 aa  123  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  29.18 
 
 
287 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  33.98 
 
 
297 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  34.88 
 
 
311 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  31.37 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  28 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  35.93 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  33 
 
 
292 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  36.97 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  27.51 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  34.75 
 
 
320 aa  112  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  34.09 
 
 
292 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.04 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  25.09 
 
 
295 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  30.83 
 
 
340 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.42 
 
 
295 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  35.41 
 
 
309 aa  106  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  28.24 
 
 
314 aa  105  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  33.82 
 
 
328 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.81 
 
 
287 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  26.44 
 
 
290 aa  102  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.24 
 
 
296 aa  102  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.95 
 
 
291 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  35.03 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.94 
 
 
296 aa  97.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  32.11 
 
 
309 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  33.03 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  33.02 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  28.84 
 
 
329 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  37.38 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.5 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  31.53 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  37.38 
 
 
294 aa  92.4  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  32.58 
 
 
310 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  38.28 
 
 
322 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  36.9 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4307  hypothetical protein  34.84 
 
 
297 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0981315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  31.8 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  36.88 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.850774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>