178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3276 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3276  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345093  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4009  hypothetical protein  99.29 
 
 		 283 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0352692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  44 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  41.18 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  50.2 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  44.58 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  44.18 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0789  hypothetical protein  44.58 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.025632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1384  hypothetical protein  50 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1126  hypothetical protein  48.78 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4307  hypothetical protein  43.78 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0981315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  44.14 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  29.24 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  32.69 
 
 		 331 aa  89  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  28.37 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  27.88 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  29.88 
 
 		 317 aa  86.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  30.45 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  30.45 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  30.45 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  41.67 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  27.4 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  28.57 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  24.69 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.4 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  30.08 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  29.95 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  38.92 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  37.84 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  30 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  30.85 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  33.49 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  21.51 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.19 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  44.55 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  27.04 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  31.78 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  35.85 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  27.27 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  27.14 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  26.87 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  28.75 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  26.77 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  26.77 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  30.46 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  36 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  29.24 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  29.3 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  27.71 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  31.05 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  30.71 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  29.24 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  30.21 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  27.39 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  29.21 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.44 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  29.21 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  38.24 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  29.2 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  29.18 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  26.75 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  34.13 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  29.17 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  27.35 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  30.21 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  33.64 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  28.03 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  32.35 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  33.01 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  27.49 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.1 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  28.57 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  30.69 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  41.79 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  27.94 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  45.9 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.05 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  32.65 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  34.74 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  35.64 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  30.84 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.27 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.16 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  23 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  30.19 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  33.71 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  42.53 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  34.69 
 
 		 430 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  21.11 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.13 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  33.66 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  32.32 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  45.9 
 
 		 433 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  28.85 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  36.29 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  44.83 
 
 		 473 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  39.33 
 
 		 444 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.21 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>