197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0822 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  99.35 
 
 
309 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0789  hypothetical protein  92.9 
 
 
310 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.025632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4307  hypothetical protein  70.37 
 
 
297 aa  359  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0981315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1005  protein of unknown function DUF58  70.85 
 
 
322 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0328767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1384  hypothetical protein  67.21 
 
 
306 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  48.98 
 
 
319 aa  242  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  43.65 
 
 
302 aa  188  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3276  hypothetical protein  46.19 
 
 
283 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345093  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4009  hypothetical protein  46.19 
 
 
283 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0352692  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  32.91 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1126  hypothetical protein  45.27 
 
 
232 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  32.24 
 
 
303 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  31.78 
 
 
303 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  28.09 
 
 
308 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  30 
 
 
324 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  32.33 
 
 
312 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  28.35 
 
 
323 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  29.63 
 
 
317 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  35.37 
 
 
318 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  30.38 
 
 
314 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  30.13 
 
 
310 aa  99.4  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  33.54 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  32.02 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  31.62 
 
 
318 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  26.84 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  29.84 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  33.61 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  32.9 
 
 
329 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  35.18 
 
 
312 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  23.28 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  31.95 
 
 
393 aa  96.3  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  32.22 
 
 
322 aa  95.9  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  36.77 
 
 
334 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  36.54 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  32.12 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.82 
 
 
320 aa  92.8  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  29.67 
 
 
345 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  32.91 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  27.95 
 
 
330 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  36.02 
 
 
320 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  35.35 
 
 
335 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  27.95 
 
 
331 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  34.56 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  30.4 
 
 
314 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  27.95 
 
 
331 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  31.07 
 
 
331 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  30.4 
 
 
314 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  29.3 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  34.15 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  34.78 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  33.54 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  33.54 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  33.54 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  33.53 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  37.24 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  30.13 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  36.54 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  30.13 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  32.18 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  27.35 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  33.13 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  25.1 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.47 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  31.47 
 
 
351 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  36.09 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  29.41 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.5 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  23.13 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  32.21 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  37.68 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  35.24 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  31.69 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  25.39 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  34.23 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  25.36 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.08 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  31.01 
 
 
287 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  33.83 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  32.7 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1735  hypothetical protein  26.06 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal  0.740515 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  32 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  30.29 
 
 
329 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  34.06 
 
 
296 aa  62.4  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25.94 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.45 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.91 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.13 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  28.12 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0049  protein of unknown function DUF58  39.25 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  32.24 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  30.17 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  27.83 
 
 
353 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  50 
 
 
430 aa  60.1  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  31.67 
 
 
309 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>