50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4513 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  557  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  96.54 
 
 		 289 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  89.27 
 
 		 289 aa  484  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  73.38 
 
 		 284 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  57.4 
 
 		 283 aa  248  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  47.86 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  50.55 
 
 		 291 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  41.52 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  41.3 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  40.51 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  42.86 
 
 		 284 aa  169  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  41.48 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  41.07 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  35.79 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  37.28 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  37.33 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  38.85 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  37.5 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  33.96 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  35.32 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.5 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  27.19 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  30.32 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.76 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  36.36 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.47 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  23.53 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  25.6 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.32 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  26.64 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.24 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  30.93 
 
 		 353 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  24.77 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.92 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.82 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  34.62 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  27.85 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.21 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  31.52 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  27.52 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.9 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  24.42 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  30.65 
 
 		 340 aa  46.2  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  27.88 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  28.32 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.09 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  27.92 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  33.81 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>