74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0476 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  555  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  49.26 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  48.57 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  47.86 
 
 		 289 aa  238  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  47.08 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  51.34 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  44.04 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  42.18 
 
 		 284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  38.46 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  36.23 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  39.49 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  39.21 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  35.66 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  32.85 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  37.99 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  34.89 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  34.13 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  36.3 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  35.92 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  33.58 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  31.9 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  31.03 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  31.12 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  32.5 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  24.18 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.99 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.94 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.78 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.09 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.92 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  28.76 
 
 		 363 aa  62  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  28.05 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  30.24 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  27.12 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.17 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  29.39 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  24.34 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  21.85 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  27.68 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  32.58 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  26.7 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.27 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  27.94 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  29.02 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  25.11 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  28.72 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  33.16 
 
 		 338 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  27.76 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  25.87 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  27.76 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  27.6 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  23.1 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  27.76 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.22 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.82 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  28.06 
 
 		 393 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  29.55 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  23.48 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  27.31 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  26.73 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  27.98 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25.9 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  31.05 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  28.75 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  27.75 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  27.85 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.9 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  28.19 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  27.69 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  24.26 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  26.5 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.59 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2702  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  26.56 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>