80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4205 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  72.3 
 
 		 289 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  73.38 
 
 		 289 aa  360  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  72.3 
 
 		 289 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  57.75 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  47.08 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  48.26 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  39.64 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  37.59 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  39.35 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  42.46 
 
 		 284 aa  161  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  39.93 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  39.26 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  32.58 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  39.58 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  38.52 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  40.36 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  34.95 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  34.05 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  37.55 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.07 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.88 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.7 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.73 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  32.35 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  30.08 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  28.8 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  34.48 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  35.29 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.7 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23.61 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  32.14 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  31.05 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  33 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  27.72 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  31.05 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  34.8 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  31.58 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  31.62 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.93 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  31.14 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  31.14 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  31.14 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  31.53 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  31.19 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5170  protein of unknown function DUF58  33.87 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  32.21 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  31.98 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.44 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  32.52 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  27.96 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  30.69 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  31.03 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  29.68 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.98 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  32.03 
 
 		 331 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  21.67 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.84 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  31.05 
 
 		 338 aa  45.8  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.51 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  27.44 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  33.03 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  32.67 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  29.32 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  27.18 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  29.32 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  25.88 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  30.81 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  31.51 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  31.51 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  33.18 
 
 		 350 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.6 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  29.41 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  32.76 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  26.01 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  29.52 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  28.23 
 
 		 318 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>