107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4032 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4032  putative MxaS-like protein  100 
 
 
287 aa  564  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2420  putative MxaS-like protein  61.59 
 
 
289 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.58376  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3802  putative MxaS-like protein  59.12 
 
 
296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3048  hypothetical protein  60.48 
 
 
291 aa  336  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3277  hypothetical protein  65.31 
 
 
294 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1896  hypothetical protein  39.72 
 
 
286 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1895  hypothetical protein  42.55 
 
 
284 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0784  hypothetical protein  40.43 
 
 
280 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294536  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4627  hypothetical protein  42.07 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0516119  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2039  hypothetical protein  37.59 
 
 
287 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4145  hypothetical protein  41.85 
 
 
289 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1526  hypothetical protein  37.81 
 
 
279 aa  155  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0688  hypothetical protein  31.69 
 
 
287 aa  155  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475275  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4513  hypothetical protein  41.48 
 
 
289 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0425654  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1824  hypothetical protein  37.14 
 
 
290 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0476  hypothetical protein  37.99 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4205  hypothetical protein  39.19 
 
 
284 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594693  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8035  hypothetical protein  38.6 
 
 
283 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1912  hypothetical protein  36.75 
 
 
291 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2998  hypothetical protein  29.11 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0475607  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  32.58 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  30.73 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  28.45 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  30 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  28.9 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  36.1 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  30.29 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  31.21 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.12 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  28.46 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  31.05 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.02 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  28.44 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.5 
 
 
291 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.46 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  30.14 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  29.36 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  25.22 
 
 
295 aa  62.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.52 
 
 
296 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  30.08 
 
 
393 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  29.96 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  26.67 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  26.21 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.98 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  31.09 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  19.92 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  29.25 
 
 
292 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  28.93 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.31 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  28.92 
 
 
310 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  30 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  22.96 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.51 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  26.64 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  30.73 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  27.69 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  28.92 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  29.13 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  29.78 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  29.69 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  26.73 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  28.7 
 
 
341 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1748  hypothetical protein  28.82 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  29.82 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  26.75 
 
 
319 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  22.13 
 
 
296 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  27.62 
 
 
300 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  29.46 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  28.14 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  28.39 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  28.02 
 
 
328 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  25.18 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  27.17 
 
 
331 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  29.18 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3262  von Willebrand factor type A  27.48 
 
 
306 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  31.22 
 
 
334 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  25.45 
 
 
323 aa  48.9  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  28.91 
 
 
338 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  26.01 
 
 
328 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  26.34 
 
 
286 aa  48.9  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  25.3 
 
 
312 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  25.93 
 
 
351 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  26.27 
 
 
353 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  27.09 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  29.3 
 
 
328 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  22.53 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  31.54 
 
 
350 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  32.09 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  25.13 
 
 
444 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  27.39 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  24.8 
 
 
309 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  20.18 
 
 
288 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  27 
 
 
310 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  25.82 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  29.57 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  28.31 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  24.29 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  28.07 
 
 
331 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  24.8 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  30.85 
 
 
312 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>