72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0713 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0713  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  643    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.689852 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1988  hypothetical protein  40.6 
 
 		 291 aa  193  4e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  31.25 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  28.09 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  29.36 
 
 		 298 aa  93.2  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  28.85 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  27.18 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  26.95 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  24.09 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  25.79 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  25.79 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  25.79 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  27.78 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  25.79 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  26.12 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  27.05 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  29.1 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  24.89 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  25.96 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  23.11 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  26.98 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  26.04 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  26.87 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  24.75 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  24.12 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  22.87 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  24.58 
 
 		 448 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  25.67 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  25 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  27.06 
 
 		 446 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  29.59 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  26.17 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  24.77 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  22.73 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  36.36 
 
 		 391 aa  50.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  24.67 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  32.14 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.85 
 
 		 440 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  30.77 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  28.02 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  24.53 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  19.48 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  25.77 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  34.57 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  30.93 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  25.11 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  25.11 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  25.11 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  24.54 
 
 		 444 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  24.17 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  22.77 
 
 		 350 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  30.12 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  25.71 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  23.7 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  23.7 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  26.09 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  26.74 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  26.28 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  32.29 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  26.28 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1427  hypothetical protein  35.85 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0646612  hitchhiker  0.0048399 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  28.1 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  26.28 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  30.39 
 
 		 444 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  20.38 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  28.75 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.36 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  30 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  23.36 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  30.15 
 
 		 469 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  33.8 
 
 		 455 aa  42.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  30.63 
 
 		 329 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>