36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0660 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0660  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  641    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299067  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  28.7 
 
 
407 aa  63.9  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  35.41 
 
 
463 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  32.74 
 
 
431 aa  60.1  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  31.79 
 
 
431 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  32.08 
 
 
415 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  33.33 
 
 
391 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  34.15 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  29.38 
 
 
432 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  25.23 
 
 
294 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  31.66 
 
 
564 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  29.27 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  30.25 
 
 
387 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  34.31 
 
 
431 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  30.69 
 
 
421 aa  50.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  31.17 
 
 
380 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  34.33 
 
 
395 aa  49.3  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.89 
 
 
380 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  30.41 
 
 
479 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  30.63 
 
 
430 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  21.89 
 
 
363 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.62 
 
 
440 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  28.1 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  26.57 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  28.51 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0388  protein of unknown function DUF58  29 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  24.39 
 
 
440 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  27.94 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  34.74 
 
 
411 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  29.51 
 
 
424 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  24.8 
 
 
402 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  26.72 
 
 
444 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1427  hypothetical protein  44.44 
 
 
423 aa  43.5  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0646612  hitchhiker  0.0048399 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2955  conserved repeat domain protein  35.48 
 
 
546 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  30.21 
 
 
419 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  21.43 
 
 
422 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>