114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0405 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0405  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  896    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0482849 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0817  hypothetical protein  25 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2402  hypothetical protein  26.61 
 
 
415 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165226  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0682  hypothetical protein  21.74 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0197418  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0389  protein of unknown function DUF58  22.76 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.004479 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0877  hypothetical protein  23.53 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000273941  hitchhiker  0.00000556126 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  37.31 
 
 
331 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  36.99 
 
 
295 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  39.39 
 
 
320 aa  53.9  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  22.61 
 
 
443 aa  53.5  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  22.13 
 
 
519 aa  53.5  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  35.8 
 
 
335 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  44.23 
 
 
283 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  40.82 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  34.21 
 
 
341 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  36.11 
 
 
292 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  33.96 
 
 
319 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  27.64 
 
 
286 aa  51.6  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  29.37 
 
 
431 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  38.18 
 
 
295 aa  50.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  38.46 
 
 
353 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  36.36 
 
 
311 aa  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  35.19 
 
 
295 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  24.59 
 
 
399 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  28.4 
 
 
302 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  26.82 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  35.59 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  34.69 
 
 
294 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2154  protein of unknown function DUF58  21.99 
 
 
482 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.690685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  40.43 
 
 
340 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  36.84 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  33.96 
 
 
296 aa  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  40.43 
 
 
340 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  37.29 
 
 
303 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  34.69 
 
 
433 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  33.33 
 
 
462 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  32.08 
 
 
306 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  46.43 
 
 
407 aa  47.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  38.46 
 
 
298 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  32.08 
 
 
328 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  32.08 
 
 
308 aa  47.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  36 
 
 
312 aa  47  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  33.68 
 
 
458 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  30.43 
 
 
320 aa  46.6  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  43.14 
 
 
375 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  28.87 
 
 
298 aa  46.6  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  36.51 
 
 
287 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  30.88 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  32.67 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  26.37 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  33.96 
 
 
290 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  34.62 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  32.65 
 
 
294 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  29.09 
 
 
489 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2108  protein of unknown function DUF58  22.07 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0520788  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  36.73 
 
 
320 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
310 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  52.94 
 
 
276 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  33.96 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  34.69 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  34.69 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  34.29 
 
 
309 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  34.69 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  34.69 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  24.81 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  30.65 
 
 
440 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  27.72 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  40.38 
 
 
561 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  36.73 
 
 
302 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  34.69 
 
 
296 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  32.22 
 
 
446 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  32.65 
 
 
473 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  32.08 
 
 
424 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  28.75 
 
 
322 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  30.65 
 
 
441 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  34.69 
 
 
444 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  28.3 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  32.14 
 
 
297 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  43.14 
 
 
326 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  38.64 
 
 
434 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3276  hypothetical protein  34 
 
 
283 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345093  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  39.13 
 
 
304 aa  44.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4009  hypothetical protein  34 
 
 
283 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0352692  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  29.07 
 
 
308 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  48.48 
 
 
395 aa  44.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  34.88 
 
 
286 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1735  hypothetical protein  36.73 
 
 
303 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal  0.740515 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1638  protein of unknown function DUF58  45.24 
 
 
241 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.717641 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  33.96 
 
 
302 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.69 
 
 
287 aa  43.9  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  29.06 
 
 
432 aa  44.3  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  28.85 
 
 
405 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  32.65 
 
 
454 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  32.76 
 
 
384 aa  43.9  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  37.5 
 
 
444 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  48.48 
 
 
410 aa  43.9  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  30.61 
 
 
449 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>