29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2402 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2402  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  816    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165226  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0389  protein of unknown function DUF58  34.47 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.004479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0682  hypothetical protein  31.01 
 
 		 427 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0197418  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0817  hypothetical protein  29.23 
 
 		 433 aa  136  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0877  hypothetical protein  27.55 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000273941  hitchhiker  0.00000556126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0405  hypothetical protein  25.66 
 
 		 434 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0482849 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  29.67 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.54 
 
 		 296 aa  51.6  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  32.14 
 
 		 296 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.72 
 
 		 295 aa  50.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  32.48 
 
 		 292 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.96 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0092  protein of unknown function DUF58  27.87 
 
 		 473 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  30.7 
 
 		 297 aa  46.6  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  29.06 
 
 		 309 aa  46.6  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.83 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  44.68 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  21.99 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  35.09 
 
 		 479 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  29.82 
 
 		 316 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 292 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  34.34 
 
 		 304 aa  43.9  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  35.48 
 
 		 300 aa  43.9  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  24.8 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  29.46 
 
 		 302 aa  43.5  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  32.58 
 
 		 298 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  39.58 
 
 		 314 aa  43.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  33.96 
 
 		 296 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  31.87 
 
 		 350 aa  42.7  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>