35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0682 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0682  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  868    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0197418  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2402  hypothetical protein  30.32 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165226  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0817  hypothetical protein  25.54 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0389  protein of unknown function DUF58  27.85 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.004479 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0877  hypothetical protein  25.46 
 
 		 420 aa  93.6  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000273941  hitchhiker  0.00000556126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0405  hypothetical protein  21.99 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0482849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  30.41 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  34.9 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  27.68 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  31.29 
 
 		 290 aa  59.7  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  31.48 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  34.53 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  28.4 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  32.61 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.79 
 
 		 288 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  30.97 
 
 		 479 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  29.93 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.95 
 
 		 291 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  31.39 
 
 		 292 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  28.18 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.53 
 
 		 295 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  32.99 
 
 		 302 aa  47.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  32.05 
 
 		 314 aa  46.6  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  41.67 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.47 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  38.33 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  28.21 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  34.62 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  30.65 
 
 		 303 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  31.96 
 
 		 309 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  36.07 
 
 		 291 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  30.85 
 
 		 303 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  42.86 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  39.39 
 
 		 288 aa  43.9  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  45.24 
 
 		 335 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>