48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0817 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0817  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  892    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0389  protein of unknown function DUF58  26.89 
 
 
413 aa  142  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.004479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2402  hypothetical protein  27.88 
 
 
415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.165226  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0405  hypothetical protein  24.87 
 
 
434 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0482849 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0682  hypothetical protein  25.54 
 
 
427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0197418  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0877  hypothetical protein  27 
 
 
420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000273941  hitchhiker  0.00000556126 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0092  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  33.66 
 
 
314 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  31.63 
 
 
287 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  55 
 
 
291 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  23.85 
 
 
489 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  28.28 
 
 
320 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  24.64 
 
 
306 aa  50.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  38.18 
 
 
291 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  35.21 
 
 
311 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.45 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  24.4 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  25.38 
 
 
519 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  31.33 
 
 
458 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  29.14 
 
 
292 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  38.89 
 
 
295 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  26.26 
 
 
312 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  50 
 
 
295 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  30.23 
 
 
290 aa  47.4  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  32.91 
 
 
292 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  28.43 
 
 
287 aa  47  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  23.11 
 
 
436 aa  46.6  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  25.56 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  34.38 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.87 
 
 
297 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  23.27 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  34.38 
 
 
296 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  30.39 
 
 
345 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  32.84 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  32.73 
 
 
288 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  36.36 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  32.89 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  47.5 
 
 
296 aa  44.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  32.79 
 
 
322 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  36.36 
 
 
296 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  27.5 
 
 
335 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  22.88 
 
 
418 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  42.59 
 
 
286 aa  43.5  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.74 
 
 
440 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  27.78 
 
 
319 aa  43.5  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  31.94 
 
 
287 aa  43.1  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  29.79 
 
 
353 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  32 
 
 
334 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>