230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2154 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2154  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
482 aa  945    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.690685  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  38.56 
 
 
519 aa  290  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0092  protein of unknown function DUF58  38.81 
 
 
473 aa  286  5e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  39.23 
 
 
489 aa  282  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  34.35 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  35.38 
 
 
295 aa  67  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  39.44 
 
 
331 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  39.44 
 
 
331 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  39.44 
 
 
330 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.72 
 
 
458 aa  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  35.29 
 
 
290 aa  62.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  27.78 
 
 
443 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  29.94 
 
 
341 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  36.19 
 
 
296 aa  61.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  29.38 
 
 
432 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  28.49 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  30.2 
 
 
318 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  40.3 
 
 
331 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  26.24 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  31.07 
 
 
287 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  27.57 
 
 
443 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  45.9 
 
 
334 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  30.2 
 
 
318 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  38.71 
 
 
320 aa  57.4  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  35.23 
 
 
447 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  39.71 
 
 
311 aa  57  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  32.67 
 
 
300 aa  57  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  30.22 
 
 
295 aa  57  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  43.94 
 
 
418 aa  57  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  32.69 
 
 
298 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  40.3 
 
 
316 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  34.09 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  29.84 
 
 
291 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  35.82 
 
 
319 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  26.62 
 
 
303 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  37.88 
 
 
310 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  33.09 
 
 
442 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  31.93 
 
 
287 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  30 
 
 
302 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  27.52 
 
 
296 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  55.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  30.1 
 
 
287 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  36.36 
 
 
444 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  31.14 
 
 
314 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  41.67 
 
 
335 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  39.66 
 
 
312 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  39.44 
 
 
309 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  36.36 
 
 
443 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  45.71 
 
 
433 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  31.45 
 
 
328 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  31.82 
 
 
300 aa  54.7  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.32 
 
 
309 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  32.14 
 
 
306 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  32.89 
 
 
329 aa  53.9  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  38.46 
 
 
303 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  32.54 
 
 
314 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  44.29 
 
 
308 aa  53.5  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  44.07 
 
 
292 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  30.15 
 
 
317 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  32.95 
 
 
444 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  35.06 
 
 
304 aa  53.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  31.58 
 
 
302 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  31.63 
 
 
328 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  31.03 
 
 
321 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  41.67 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  31.37 
 
 
288 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  31.37 
 
 
287 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  31.1 
 
 
575 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  33.33 
 
 
329 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  21.89 
 
 
443 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  37.18 
 
 
303 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  29.89 
 
 
308 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  39.19 
 
 
298 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  37.7 
 
 
312 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  28.45 
 
 
446 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  32.1 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  31.58 
 
 
302 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  31.58 
 
 
302 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  31.21 
 
 
298 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  27.63 
 
 
393 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  40.38 
 
 
345 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  39.71 
 
 
312 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  31.9 
 
 
391 aa  52  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  39.71 
 
 
312 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.42 
 
 
283 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  34.78 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  40.91 
 
 
324 aa  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  35.71 
 
 
306 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  35.29 
 
 
358 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  40.62 
 
 
294 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  29.41 
 
 
291 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  39.6 
 
 
309 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  30.39 
 
 
309 aa  50.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  40.62 
 
 
294 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  52.08 
 
 
297 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  33.61 
 
 
311 aa  50.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  31.67 
 
 
318 aa  50.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  35.38 
 
 
434 aa  50.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  26.42 
 
 
444 aa  50.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>