142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1352 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1352  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  848    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491685  hitchhiker  0.00000471163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  85.22 
 
 
433 aa  734    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  54.04 
 
 
433 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  56.09 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0407  hypothetical protein  36.64 
 
 
415 aa  256  7e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0240441  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0092  protein of unknown function DUF58  22.55 
 
 
473 aa  76.6  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  21.74 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.78 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  20.77 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  25 
 
 
444 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  29.2 
 
 
325 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  26.75 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 
444 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  21.67 
 
 
440 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  18.96 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  21.83 
 
 
446 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  25.74 
 
 
442 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  22.54 
 
 
448 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  22.97 
 
 
426 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  33.7 
 
 
295 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  23.65 
 
 
443 aa  56.6  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  30.19 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  25.66 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  20.28 
 
 
447 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  20.75 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  19.05 
 
 
432 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  30 
 
 
444 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  25.22 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  27.66 
 
 
358 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  25.66 
 
 
405 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  22.73 
 
 
436 aa  53.5  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  24.78 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 
310 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  26.19 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  25.66 
 
 
404 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  25.22 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  25.49 
 
 
286 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  26.56 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  21.13 
 
 
407 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  22.19 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  26.11 
 
 
405 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  34.04 
 
 
297 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  23.03 
 
 
575 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  24.86 
 
 
303 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  40.58 
 
 
351 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  24.68 
 
 
402 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  24.34 
 
 
404 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 
294 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  30.53 
 
 
289 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  30.53 
 
 
289 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  30.53 
 
 
289 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  25.12 
 
 
412 aa  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  30.95 
 
 
287 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  17.73 
 
 
443 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  20.1 
 
 
519 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  32.61 
 
 
328 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  31.87 
 
 
295 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0043  hypothetical protein  27.42 
 
 
288 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  31.87 
 
 
290 aa  49.7  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  25.49 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  22.73 
 
 
302 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  29.91 
 
 
323 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  32.29 
 
 
311 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  23.81 
 
 
429 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  19.55 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  23.4 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  18.18 
 
 
443 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  33.04 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  31.91 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  28.21 
 
 
428 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  40.35 
 
 
552 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  19.19 
 
 
469 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  26.6 
 
 
297 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  24.18 
 
 
295 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  29.41 
 
 
314 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  42.59 
 
 
286 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  24.57 
 
 
283 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  24.55 
 
 
404 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  29.41 
 
 
314 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  22.3 
 
 
462 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  30.26 
 
 
473 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  23.02 
 
 
298 aa  47.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  20.54 
 
 
375 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  32.22 
 
 
292 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2826  protein of unknown function DUF58  18.97 
 
 
362 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.493704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  29.63 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1718  hypothetical protein  30.26 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  32.61 
 
 
292 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  22.53 
 
 
684 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  24.43 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  23.04 
 
 
419 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  21.5 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  40 
 
 
316 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  31.18 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  35.48 
 
 
294 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  22.58 
 
 
451 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>