55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2239 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 451 aa  926    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  32 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  30.1 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  30.1 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  26.91 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  27.13 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  25.48 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  24.03 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  32.39 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  20.96 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  23.95 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  24.09 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  26.81 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  31.69 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  29.44 
 
 		 431 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  26.48 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  28.33 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  22.98 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  31.45 
 
 		 405 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  36.43 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  24.81 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  31.58 
 
 		 422 aa  53.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  33.09 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  26.01 
 
 		 458 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  23.3 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 		 491 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  30.83 
 
 		 462 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  20.69 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  26.47 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  25.64 
 
 		 385 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  27.01 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  24.58 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  26.09 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  28.35 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  27.54 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  25.37 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  20.74 
 
 		 294 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  27.11 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  33.64 
 
 		 421 aa  47  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  25.16 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  29.75 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  25.86 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  31.97 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  24.91 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1430  protein of unknown function DUF58  29.87 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  23.98 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  28.87 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  29.08 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  33.01 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  25.14 
 
 		 275 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  31.15 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  32 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  25.1 
 
 		 384 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  27.42 
 
 		 321 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  28.31 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>