More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2517 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2517  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 
254 aa  519  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000225878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1610  30S ribosomal protein S1  29.52 
 
 
487 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1350  RNA binding S1 domain protein  24.02 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  23.71 
 
 
388 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2939  30S ribosomal protein S1  27.63 
 
 
403 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314771  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1207  30S ribosomal protein S1  29.15 
 
 
489 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  23.08 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  23.94 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000310337  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2449  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  32.8 
 
 
643 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000629318  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0408  ribosomal protein S1  26.64 
 
 
553 aa  67.4  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.460478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  28.57 
 
 
385 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  25.27 
 
 
705 aa  66.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  26.47 
 
 
677 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1607  RNA-binding S1 domain-containing protein  25.16 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00859677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  31.25 
 
 
539 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1618  RNA-binding S1 domain-containing protein  26.52 
 
 
532 aa  65.9  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  25.49 
 
 
411 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1349  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.03 
 
 
543 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.143474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0309  30S ribosomal protein S1  24.06 
 
 
564 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.470191 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1379  RNA binding S1 domain protein  27.75 
 
 
552 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0721  30S ribosomal protein S1  27.91 
 
 
558 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0686992  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  28.26 
 
 
672 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  27.45 
 
 
559 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  27.87 
 
 
399 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3713  RNA-binding S1 domain-containing protein  26.49 
 
 
397 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000276005  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  29.88 
 
 
529 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4092  RNA binding S1 domain protein  27.98 
 
 
681 aa  62.4  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000600933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  23.74 
 
 
584 aa  62.4  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  25.6 
 
 
557 aa  62.4  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2672  30S ribosomal protein S1  23.29 
 
 
399 aa  62  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1027  RNA binding S1 domain protein  27.68 
 
 
504 aa  62  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000173139  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  27.91 
 
 
571 aa  62  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  28.75 
 
 
608 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  24.88 
 
 
403 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  26.8 
 
 
405 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  26.96 
 
 
563 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  25.31 
 
 
500 aa  61.2  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  26.96 
 
 
563 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_008532  STER_0639  30S ribosomal protein S1  23.37 
 
 
400 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.136649  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1337  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.38 
 
 
543 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000610744  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2022  30S ribosomal protein S1  27 
 
 
472 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000578746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3269  30S ribosomal protein S1  24.57 
 
 
400 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  25.1 
 
 
408 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  24.42 
 
 
491 aa  59.7  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  27.27 
 
 
654 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2405  30S ribosomal protein S1  24 
 
 
378 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2117  30S ribosomal protein S1  24 
 
 
378 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0613  RNA binding S1 domain protein  26.25 
 
 
558 aa  58.9  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000620529  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0991  30S ribosomal protein S1  24.52 
 
 
400 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  26.83 
 
 
418 aa  58.5  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  28.83 
 
 
573 aa  58.5  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  23.47 
 
 
573 aa  58.5  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1429  RNA binding S1 domain protein  25.81 
 
 
514 aa  58.5  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1567  30S ribosomal protein S1  29.09 
 
 
558 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  25.88 
 
 
676 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  23.94 
 
 
415 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  25.87 
 
 
579 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1280  30S ribosomal protein S1  26.29 
 
 
559 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113187  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  26.25 
 
 
604 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  23.79 
 
 
736 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3458  30S ribosomal protein S1  28 
 
 
568 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0194  30S ribosomal protein S1  27.81 
 
 
573 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.571877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  23.74 
 
 
584 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3285  30S ribosomal protein S1  27.61 
 
 
561 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279338  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  26.74 
 
 
561 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  21.81 
 
 
400 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  23.74 
 
 
584 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1250  30S ribosomal protein S1  27.04 
 
 
557 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  25.16 
 
 
416 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  29.95 
 
 
720 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3775  RNA binding S1 domain protein  27.11 
 
 
539 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  24.07 
 
 
490 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  26.11 
 
 
661 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  26.38 
 
 
571 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  26.38 
 
 
577 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0481  30S ribosomal protein S1  24.53 
 
 
557 aa  57  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 
562 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  26.4 
 
 
403 aa  56.6  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  26.74 
 
 
561 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 
562 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  26.74 
 
 
561 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  26.38 
 
 
589 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  23.29 
 
 
609 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  23.56 
 
 
686 aa  56.2  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  26.02 
 
 
555 aa  56.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3124  30S ribosomal protein S1  27.61 
 
 
562 aa  56.2  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00164205  normal  0.0119703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  25.38 
 
 
382 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  24.49 
 
 
560 aa  56.2  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 
562 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  23.46 
 
 
493 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4724  30S ribosomal protein S1  28.31 
 
 
561 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271218  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  27.7 
 
 
570 aa  55.8  0.0000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  26.02 
 
 
559 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1322  30S ribosomal protein S1  26.99 
 
 
566 aa  55.8  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  23.23 
 
 
575 aa  55.8  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1391  30S ribosomal protein S1  27.61 
 
 
561 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00553115  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  31.2 
 
 
561 aa  55.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  26.02 
 
 
559 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  23.46 
 
 
491 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  23.84 
 
 
495 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>