More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3775 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3775  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 539 aa  1070    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6619  RNA binding S1 domain protein  34.32 
 
 		 630 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000014562  normal  0.0151044 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  34.46 
 
 		 705 aa  130  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1305  30S ribosomal protein S1  36.72 
 
 		 566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000305659  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 		 575 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  35.06 
 
 		 588 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  35.59 
 
 		 720 aa  128  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0639  30S ribosomal protein S1  36.78 
 
 		 400 aa  128  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.136649  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0644  30S ribosomal protein S1  32.52 
 
 		 611 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.35055 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  36.36 
 
 		 382 aa  126  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  36.36 
 
 		 598 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  35.59 
 
 		 570 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  34.46 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  32.39 
 
 		 556 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  29.15 
 
 		 570 aa  125  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  35.8 
 
 		 589 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  36.9 
 
 		 577 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  36.9 
 
 		 571 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3572  RNA binding S1 domain protein  37.36 
 
 		 557 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3285  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 561 aa  124  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  31.07 
 
 		 644 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1027  RNA binding S1 domain protein  34.66 
 
 		 504 aa  124  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000173139  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  34.73 
 
 		 592 aa  124  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  36.36 
 
 		 571 aa  123  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  35.59 
 
 		 567 aa  123  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2000  30S ribosomal protein S1  34.64 
 
 		 591 aa  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000749746  normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  33.9 
 
 		 577 aa  123  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  35.93 
 
 		 569 aa  123  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  35.93 
 
 		 569 aa  123  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 562 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  33.52 
 
 		 677 aa  123  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  32.95 
 
 		 672 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 562 aa  123  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 562 aa  123  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 564 aa  123  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  34.09 
 
 		 555 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  33.93 
 
 		 567 aa  123  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 564 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  35.71 
 
 		 382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2936  30S ribosomal protein S1  36.16 
 
 		 577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 		 570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  36.36 
 
 		 575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3791  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784339  hitchhiker  0.000188764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 		 569 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  36.99 
 
 		 396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 		 570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 382 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 382 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0103  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 		 569 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503388  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  36.16 
 
 		 582 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0067  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 		 565 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605902  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  35.93 
 
 		 571 aa  121  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 		 565 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 		 565 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 		 569 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0976  30S ribosomal protein S1  32.95 
 
 		 547 aa  121  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00186692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1625  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 382 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 382 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 382 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 382 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  33.52 
 
 		 584 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1592  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 382 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0386100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 		 565 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1661  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  38.15 
 
 		 408 aa  121  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10333  30S ribosomal protein S1  32.54 
 
 		 619 aa  120  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.869439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  33.52 
 
 		 584 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  33.52 
 
 		 557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  34.86 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  32.39 
 
 		 557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  34.66 
 
 		 579 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  31.82 
 
 		 556 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3458  30S ribosomal protein S1  39.31 
 
 		 568 aa  120  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0194  30S ribosomal protein S1  39.31 
 
 		 573 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.571877  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  38.42 
 
 		 558 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  31.82 
 
 		 556 aa  120  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  34.29 
 
 		 387 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1563  30S ribosomal protein S1  36.36 
 
 		 391 aa  120  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.909441  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1533  30S ribosomal protein S1  36.36 
 
 		 391 aa  120  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.920483  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  34.57 
 
 		 399 aa  120  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  35.8 
 
 		 558 aa  120  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  35.8 
 
 		 558 aa  120  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  31.82 
 
 		 609 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 		 566 aa  120  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>