More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1607 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1607  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 
365 aa  710    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00859677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  37.6 
 
 
677 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  38.12 
 
 
661 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  39.82 
 
 
736 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  37.37 
 
 
672 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  41.84 
 
 
678 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  35.5 
 
 
654 aa  239  6.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  36.81 
 
 
676 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2405  30S ribosomal protein S1  39.59 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2117  30S ribosomal protein S1  39.59 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0714  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  37.72 
 
 
694 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000369991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  35.88 
 
 
687 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  36.53 
 
 
529 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  37.72 
 
 
672 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  34.63 
 
 
720 aa  229  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  35.57 
 
 
490 aa  225  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2449  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  36.25 
 
 
643 aa  219  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000629318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  36.89 
 
 
382 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  35.48 
 
 
491 aa  218  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  35.19 
 
 
481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  34.8 
 
 
403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3791  30S ribosomal protein S1  35.45 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784339  hitchhiker  0.000188764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  34.9 
 
 
479 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  34.9 
 
 
479 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  34.9 
 
 
479 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  34.6 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  35.73 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  35.45 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.06 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  35.44 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  34.9 
 
 
481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  34.28 
 
 
416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  34.9 
 
 
481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.62 
 
 
403 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  35.44 
 
 
487 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1661  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 
382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  35.19 
 
 
500 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  34.02 
 
 
385 aa  212  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  35.33 
 
 
493 aa  212  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 
382 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 
382 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 
382 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  36.94 
 
 
705 aa  212  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1592  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 
382 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0386100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  35.03 
 
 
387 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  34.87 
 
 
382 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  34.43 
 
 
485 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1625  30S ribosomal protein S1  35.33 
 
 
382 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  34.5 
 
 
488 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  36.07 
 
 
500 aa  209  5e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  34.02 
 
 
495 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  33.43 
 
 
405 aa  209  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  34.21 
 
 
491 aa  209  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  34.21 
 
 
491 aa  209  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  36.79 
 
 
496 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  34.36 
 
 
499 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  34.43 
 
 
493 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  33.64 
 
 
427 aa  208  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  34.5 
 
 
492 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  33.24 
 
 
485 aa  208  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  34.02 
 
 
495 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  35.14 
 
 
515 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  34.5 
 
 
488 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  36.45 
 
 
485 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  34.5 
 
 
493 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  34.5 
 
 
492 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  34.6 
 
 
496 aa  206  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  34.4 
 
 
387 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  32.84 
 
 
418 aa  206  5e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  34.02 
 
 
584 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  33.53 
 
 
598 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  34.5 
 
 
488 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  33.24 
 
 
587 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  33.83 
 
 
490 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  34.52 
 
 
584 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  31.43 
 
 
596 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  34.63 
 
 
584 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  29.82 
 
 
575 aa  202  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  31.16 
 
 
644 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  33.92 
 
 
577 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  33.92 
 
 
571 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  33.92 
 
 
589 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  32.93 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
570 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
570 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
570 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
570 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
570 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
570 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
570 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
570 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
570 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
570 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
576 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
570 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
576 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
576 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 
576 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.77 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000310337  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  34.77 
 
 
597 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>