More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1379 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1379  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 552 aa  1068    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  32.54 
 
 		 577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  31.62 
 
 		 575 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  32.78 
 
 		 577 aa  273  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  32.89 
 
 		 596 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  33.8 
 
 		 570 aa  269  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  31.13 
 
 		 720 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  32.28 
 
 		 604 aa  269  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  31.01 
 
 		 573 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  29.45 
 
 		 609 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  32.72 
 
 		 574 aa  266  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  31.31 
 
 		 568 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  31.31 
 
 		 568 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  31.31 
 
 		 568 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  32.41 
 
 		 593 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  31.12 
 
 		 578 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  29.34 
 
 		 560 aa  260  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  31.13 
 
 		 584 aa  259  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  30.75 
 
 		 584 aa  256  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  32.05 
 
 		 579 aa  256  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1646  30S ribosomal protein S1  31.07 
 
 		 561 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.099465 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  30.22 
 
 		 558 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  30.22 
 
 		 558 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  29.37 
 
 		 561 aa  250  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00891  30S ribosomal protein S1  30.66 
 
 		 561 aa  249  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0317797  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  31.56 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  31.56 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  31.56 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  31.56 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  31.56 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  31.56 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  31.56 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  31.56 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  30.13 
 
 		 557 aa  247  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  31.37 
 
 		 589 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  29.72 
 
 		 584 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  28.76 
 
 		 608 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  31.37 
 
 		 570 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  31.17 
 
 		 564 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  31.37 
 
 		 570 aa  243  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  32.16 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  31.37 
 
 		 576 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  31.88 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  30.78 
 
 		 564 aa  243  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  31.18 
 
 		 576 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  31.37 
 
 		 576 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  31.18 
 
 		 576 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  31.12 
 
 		 577 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  31.12 
 
 		 571 aa  240  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  28.91 
 
 		 567 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  30.8 
 
 		 562 aa  238  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  26.67 
 
 		 560 aa  237  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  30.37 
 
 		 569 aa  236  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  30.37 
 
 		 569 aa  236  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  30.74 
 
 		 644 aa  236  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  29.72 
 
 		 557 aa  236  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  29.53 
 
 		 573 aa  236  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  30.61 
 
 		 562 aa  236  9e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  28.99 
 
 		 586 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  30.61 
 
 		 562 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  28.91 
 
 		 559 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  28.25 
 
 		 573 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  27.57 
 
 		 559 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  27.57 
 
 		 559 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  27.41 
 
 		 555 aa  231  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  26.93 
 
 		 557 aa  231  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  31.37 
 
 		 597 aa  229  8e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  30.21 
 
 		 562 aa  229  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  28.02 
 
 		 556 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  26.95 
 
 		 568 aa  229  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  26.95 
 
 		 568 aa  229  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  27.6 
 
 		 574 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  29.26 
 
 		 561 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0613  RNA binding S1 domain protein  31.94 
 
 		 558 aa  228  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000620529  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  28.38 
 
 		 553 aa  227  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  28.93 
 
 		 592 aa  228  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  28.02 
 
 		 599 aa  227  5.0000000000000005e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1349  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.73 
 
 		 543 aa  225  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.143474  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  28.49 
 
 		 558 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  29.39 
 
 		 571 aa  225  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  28.25 
 
 		 560 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  28.49 
 
 		 558 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  28.49 
 
 		 558 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0452  30S ribosomal protein S1  27.68 
 
 		 592 aa  225  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961926  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  28.49 
 
 		 558 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  27.72 
 
 		 588 aa  225  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2855  30S ribosomal protein S1  28.09 
 
 		 560 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000740795  hitchhiker  0.0000000202949 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1732  30S ribosomal protein S1  28.05 
 
 		 589 aa  224  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000125222  decreased coverage  0.00441133 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  28.68 
 
 		 558 aa  224  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  28.68 
 
 		 558 aa  223  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  26.78 
 
 		 559 aa  223  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0418  30S ribosomal protein S1  28 
 
 		 591 aa  223  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000167097  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  26.9 
 
 		 563 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1337  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.71 
 
 		 543 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000610744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4092  RNA binding S1 domain protein  30.88 
 
 		 681 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000600933  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  26.56 
 
 		 561 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2000  30S ribosomal protein S1  27.53 
 
 		 591 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000749746  normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  27.85 
 
 		 563 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  27.19 
 
 		 559 aa  221  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  26.9 
 
 		 563 aa  221  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>