More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4092 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_4092  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 681 aa  1332    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000600933  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  33.9 
 
 		 577 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1429  RNA binding S1 domain protein  36.85 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  32.77 
 
 		 577 aa  287  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 574 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  33.66 
 
 		 604 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  33.13 
 
 		 573 aa  280  8e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  32.49 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  33.52 
 
 		 593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  32.77 
 
 		 570 aa  269  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  31.11 
 
 		 584 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  31.49 
 
 		 584 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  30.38 
 
 		 579 aa  265  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  28.91 
 
 		 568 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  28.91 
 
 		 568 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  28.91 
 
 		 568 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  31.31 
 
 		 575 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  31.49 
 
 		 584 aa  257  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 573 aa  257  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  28.49 
 
 		 578 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  30.07 
 
 		 608 aa  250  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  31.31 
 
 		 574 aa  249  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  29.77 
 
 		 570 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  29.77 
 
 		 570 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  29.39 
 
 		 570 aa  249  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  28.44 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  29.39 
 
 		 569 aa  246  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0721  30S ribosomal protein S1  29.41 
 
 		 558 aa  246  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0686992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  29.36 
 
 		 560 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  31.17 
 
 		 562 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  29.2 
 
 		 569 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  29.37 
 
 		 556 aa  244  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  31.17 
 
 		 562 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  27.29 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  30.98 
 
 		 562 aa  242  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  28.96 
 
 		 558 aa  242  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  30.98 
 
 		 564 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  29.28 
 
 		 565 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  29.04 
 
 		 555 aa  239  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  28.35 
 
 		 573 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  30.78 
 
 		 564 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0200  30S ribosomal protein S1  29.03 
 
 		 558 aa  239  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  28.82 
 
 		 567 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  30.16 
 
 		 597 aa  239  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  29.17 
 
 		 553 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1280  30S ribosomal protein S1  30.06 
 
 		 559 aa  238  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  29.59 
 
 		 561 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  29.28 
 
 		 565 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0103  30S ribosomal protein S1  28.98 
 
 		 569 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.924927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  28.44 
 
 		 569 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  29.83 
 
 		 589 aa  239  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  29.83 
 
 		 571 aa  238  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  29.13 
 
 		 555 aa  238  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  29.83 
 
 		 577 aa  238  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  28.05 
 
 		 561 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  28.9 
 
 		 567 aa  238  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  31.05 
 
 		 586 aa  238  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2936  30S ribosomal protein S1  28.57 
 
 		 577 aa  237  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  28.05 
 
 		 561 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  28.05 
 
 		 561 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  29.09 
 
 		 565 aa  237  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  29.01 
 
 		 555 aa  237  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  29.06 
 
 		 555 aa  236  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  30.06 
 
 		 569 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  30.06 
 
 		 569 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  29.09 
 
 		 566 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 557 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 557 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  28.91 
 
 		 555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 557 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  29.5 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  29.49 
 
 		 558 aa  235  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  29.49 
 
 		 558 aa  235  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  30.14 
 
 		 568 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  29.5 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  29.5 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 557 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 557 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 557 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  28.91 
 
 		 555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00922  hypothetical protein  29.58 
 
 		 557 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.750734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  29.5 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 557 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  29.5 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  29.5 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1072  30S ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 557 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000956942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  29.5 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  28.91 
 
 		 555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  28.91 
 
 		 555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  28.91 
 
 		 555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  29.5 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  30.14 
 
 		 568 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1014  30S ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 557 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  30.18 
 
 		 562 aa  234  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1079  30S ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 557 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0828489 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1046  30S ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 557 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0987  30S ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 557 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0123742  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1094  30S ribosomal protein S1  29.58 
 
 		 557 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.613662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  30.82 
 
 		 555 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>