More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1795 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  100 
 
 
539 aa  1088    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  37.83 
 
 
609 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  39 
 
 
574 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  40.21 
 
 
573 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  39.09 
 
 
586 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  38.95 
 
 
596 aa  362  7.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  38.76 
 
 
584 aa  359  7e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  40.2 
 
 
579 aa  359  7e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  38.83 
 
 
584 aa  356  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  38.63 
 
 
584 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  40.4 
 
 
578 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  37.55 
 
 
560 aa  352  8.999999999999999e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  40.62 
 
 
568 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  40.62 
 
 
568 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  40.62 
 
 
568 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  40.09 
 
 
560 aa  352  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5663  RNA binding S1 domain protein  35.82 
 
 
595 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726551  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  38.74 
 
 
556 aa  343  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02120  30S ribosomal subunit protein S1  37.66 
 
 
504 aa  343  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000618962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  37.92 
 
 
557 aa  343  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  37.26 
 
 
574 aa  342  7e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  38.05 
 
 
553 aa  342  8e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  39.29 
 
 
568 aa  342  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  39.29 
 
 
568 aa  342  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
570 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  36.29 
 
 
575 aa  342  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
576 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
570 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
570 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
570 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
570 aa  342  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
570 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  39 
 
 
559 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
576 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  39 
 
 
559 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
570 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
576 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  38.34 
 
 
559 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
570 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
570 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  37.53 
 
 
597 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
570 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
576 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 
570 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  39.07 
 
 
558 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  41.47 
 
 
598 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  35.69 
 
 
604 aa  340  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  41.1 
 
 
573 aa  340  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  36.74 
 
 
577 aa  339  9e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  41.5 
 
 
589 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  41.5 
 
 
571 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  38.19 
 
 
577 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  39.96 
 
 
577 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  37.26 
 
 
555 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  37.47 
 
 
555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  37.01 
 
 
558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  37.01 
 
 
558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  37.01 
 
 
558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  42.36 
 
 
573 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  37.01 
 
 
558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  38.34 
 
 
560 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  41.01 
 
 
569 aa  336  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  37.47 
 
 
561 aa  336  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  33.78 
 
 
570 aa  334  2e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  35.5 
 
 
557 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  37.05 
 
 
555 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  37.05 
 
 
555 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2855  30S ribosomal protein S1  37.31 
 
 
560 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000740795  hitchhiker  0.0000000202949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  37.05 
 
 
555 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  37.61 
 
 
560 aa  335  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  37.05 
 
 
555 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  40.35 
 
 
562 aa  335  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  37.75 
 
 
555 aa  334  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  36.57 
 
 
559 aa  334  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  36.29 
 
 
556 aa  333  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  41.84 
 
 
569 aa  333  4e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  41.84 
 
 
569 aa  333  4e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3013  30S ribosomal protein S1  37.22 
 
 
556 aa  333  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000348916  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  41.83 
 
 
571 aa  333  5e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  36.29 
 
 
556 aa  333  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  36.84 
 
 
555 aa  333  6e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  36.63 
 
 
556 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  34.85 
 
 
557 aa  333  7.000000000000001e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4724  30S ribosomal protein S1  39.69 
 
 
561 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271218  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  38.53 
 
 
564 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  36.63 
 
 
555 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  36.63 
 
 
555 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  35.52 
 
 
720 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  36.63 
 
 
555 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  36.63 
 
 
555 aa  331  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  37.19 
 
 
563 aa  331  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  38.53 
 
 
564 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1391  30S ribosomal protein S1  39.51 
 
 
561 aa  331  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00553115  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0976  30S ribosomal protein S1  38.63 
 
 
547 aa  331  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00186692  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  38.58 
 
 
561 aa  331  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  37.05 
 
 
555 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3478  30S ribosomal protein S1  34.35 
 
 
598 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.199022  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  34.33 
 
 
644 aa  331  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2469  30S ribosomal protein S1  39.51 
 
 
561 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.327946  normal  0.369216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  39.39 
 
 
569 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>