More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3713 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3713  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 397 aa  788    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000276005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  63.81 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  64.81 
 
 		 393 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000310337  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  66.86 
 
 		 388 aa  487  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.45 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.59 
 
 		 411 aa  349  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  48.55 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.16 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1350  RNA binding S1 domain protein  48.56 
 
 		 431 aa  316  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  42.74 
 
 		 485 aa  267  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  42.13 
 
 		 492 aa  265  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  42.57 
 
 		 490 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  42.27 
 
 		 481 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  42.27 
 
 		 481 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  42.23 
 
 		 492 aa  262  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  41.52 
 
 		 493 aa  262  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  38.89 
 
 		 672 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  41.97 
 
 		 480 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  41.98 
 
 		 479 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  41.69 
 
 		 495 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  40.35 
 
 		 676 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  41.98 
 
 		 479 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  41.98 
 
 		 479 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  42.57 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  42.57 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  41.69 
 
 		 481 aa  260  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  41.94 
 
 		 496 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  42.17 
 
 		 493 aa  259  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  42.11 
 
 		 487 aa  259  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  40.69 
 
 		 488 aa  257  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  41.69 
 
 		 488 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  40.96 
 
 		 495 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  40.4 
 
 		 491 aa  258  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  40.88 
 
 		 515 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  41.23 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  40.06 
 
 		 500 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  41.23 
 
 		 499 aa  256  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  40.64 
 
 		 485 aa  256  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  40.69 
 
 		 490 aa  256  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  40.94 
 
 		 487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  40.82 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  40.67 
 
 		 736 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  40.82 
 
 		 493 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  40.68 
 
 		 492 aa  252  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  42.94 
 
 		 654 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  39.57 
 
 		 678 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  40.35 
 
 		 488 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  38.61 
 
 		 529 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  41.47 
 
 		 505 aa  250  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  39.62 
 
 		 418 aa  249  5e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  41.12 
 
 		 500 aa  248  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  39.39 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  40.41 
 
 		 598 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  38.02 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  38.89 
 
 		 677 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  35.68 
 
 		 705 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  39.54 
 
 		 485 aa  242  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  37.9 
 
 		 557 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  41.4 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  41.4 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  37.29 
 
 		 661 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  37.46 
 
 		 568 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  37.46 
 
 		 568 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  35.36 
 
 		 558 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3767  RNA binding S1 domain-containing protein  41.35 
 
 		 507 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0768989  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  37.1 
 
 		 556 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  36.58 
 
 		 555 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  33.52 
 
 		 557 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  35.59 
 
 		 686 aa  228  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  38.6 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  35.28 
 
 		 687 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  35.99 
 
 		 564 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  35.99 
 
 		 564 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  39.32 
 
 		 407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  35.99 
 
 		 562 aa  226  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  38.37 
 
 		 558 aa  226  7e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  35.99 
 
 		 562 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  35.99 
 
 		 562 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  35.33 
 
 		 569 aa  225  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  35.33 
 
 		 569 aa  225  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  37.98 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  36.28 
 
 		 561 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  35.4 
 
 		 576 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  34.31 
 
 		 720 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  36.93 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  35.4 
 
 		 576 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1533  30S ribosomal protein S1  40.29 
 
 		 391 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.920483  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  38.37 
 
 		 382 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  35.4 
 
 		 570 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  35.4 
 
 		 570 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1563  30S ribosomal protein S1  40.29 
 
 		 391 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.909441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  35.4 
 
 		 576 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  35.4 
 
 		 576 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  36.58 
 
 		 562 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  35.4 
 
 		 570 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  38.08 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  38.08 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  35.4 
 
 		 570 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  35.4 
 
 		 570 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  35.4 
 
 		 570 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>