266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06942 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  317  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  43.04 
 
 		 417 aa  117  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  37.59 
 
 		 418 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  40 
 
 		 410 aa  101  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  41.01 
 
 		 424 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 		 420 aa  87.4  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  38.02 
 
 		 452 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  38.02 
 
 		 452 aa  84.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  36.97 
 
 		 432 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  37.96 
 
 		 449 aa  78.2  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  37.5 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  36.54 
 
 		 432 aa  74.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  33.54 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  30.83 
 
 		 434 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 		 428 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  34.96 
 
 		 447 aa  70.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  36.62 
 
 		 424 aa  70.9  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  35.9 
 
 		 433 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  35.54 
 
 		 444 aa  67  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  39.62 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  32.41 
 
 		 433 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.81 
 
 		 450 aa  65.1  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  31.54 
 
 		 449 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.65 
 
 		 453 aa  64.3  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  36.61 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 		 462 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  28.57 
 
 		 408 aa  61.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 447 aa  60.8  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 		 444 aa  58.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  30.38 
 
 		 437 aa  58.2  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 484 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 449 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  31.52 
 
 		 431 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 422 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  34.45 
 
 		 484 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 436 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 454 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  31.36 
 
 		 438 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  32.03 
 
 		 422 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 438 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  32.03 
 
 		 422 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  32.61 
 
 		 435 aa  53.9  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  34.82 
 
 		 423 aa  53.9  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 		 422 aa  53.9  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.67 
 
 		 458 aa  53.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 435 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  36.7 
 
 		 440 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  31.36 
 
 		 440 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 467 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  29.75 
 
 		 456 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.03 
 
 		 437 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 437 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.03 
 
 		 437 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  35.85 
 
 		 440 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 		 457 aa  51.2  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.33 
 
 		 450 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  30.08 
 
 		 477 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 423 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 436 aa  50.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  34.09 
 
 		 447 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 		 435 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 424 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 		 424 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 		 435 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  31.75 
 
 		 480 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 439 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 455 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 435 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 455 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 		 473 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  31.3 
 
 		 445 aa  49.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  27.42 
 
 		 447 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 477 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 434 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 450 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 455 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2482  extracellular solute-binding protein family 1  31.96 
 
 		 400 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0758562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  29.41 
 
 		 439 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.64 
 
 		 423 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 		 424 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.95 
 
 		 416 aa  48.5  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 429 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 436 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  32.26 
 
 		 438 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 427 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2792  extracellular solute-binding protein family 1  30.88 
 
 		 411 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.36 
 
 		 445 aa  47.8  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 430 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 439 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 451 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 		 424 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  31.78 
 
 		 441 aa  47.4  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 439 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 441 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  31.54 
 
 		 422 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 436 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  30.39 
 
 		 420 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 435 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>