More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3908 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  100 
 
 		 393 aa  746    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  65.13 
 
 		 389 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  66.49 
 
 		 389 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  65.9 
 
 		 388 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  65.13 
 
 		 388 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  65.13 
 
 		 388 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  64.95 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  68.15 
 
 		 398 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  62.6 
 
 		 372 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  64.31 
 
 		 352 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  58.68 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  57.65 
 
 		 390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  59.9 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  58.38 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  55.68 
 
 		 437 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  57.36 
 
 		 401 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  50.65 
 
 		 387 aa  316  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  55.95 
 
 		 415 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  52.89 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  52.76 
 
 		 383 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  47.97 
 
 		 432 aa  279  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50.9 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  57.46 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  51.7 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  57.68 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  51.17 
 
 		 378 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  53.27 
 
 		 514 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  51.75 
 
 		 492 aa  265  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  46.91 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50 
 
 		 419 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  47.78 
 
 		 433 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  44.08 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  49.59 
 
 		 393 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  38.96 
 
 		 445 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  39.83 
 
 		 468 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  39.55 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  50.94 
 
 		 405 aa  248  9e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  42.07 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 464 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  40.47 
 
 		 455 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  35.77 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  40.76 
 
 		 455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  42.63 
 
 		 462 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  39.33 
 
 		 459 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  42.9 
 
 		 454 aa  245  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  40.29 
 
 		 456 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  41.86 
 
 		 463 aa  245  9e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  40.35 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  40.91 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  40.47 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  43.07 
 
 		 386 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  43.85 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  42.9 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 624 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  41.04 
 
 		 450 aa  243  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  43.89 
 
 		 442 aa  243  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  39.94 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  42.18 
 
 		 462 aa  242  7e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  38.21 
 
 		 463 aa  242  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  39.19 
 
 		 457 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  43.21 
 
 		 449 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  40.18 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  40.18 
 
 		 455 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  41.39 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  41.9 
 
 		 480 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  40.18 
 
 		 455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  41.39 
 
 		 472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  41.23 
 
 		 472 aa  240  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 454 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  41.72 
 
 		 474 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  38.72 
 
 		 521 aa  239  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  43.19 
 
 		 454 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  43.19 
 
 		 454 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 451 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 451 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  41.82 
 
 		 458 aa  239  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  42.55 
 
 		 417 aa  239  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  41.49 
 
 		 482 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  39.88 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  37.69 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  37.6 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  41.9 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  40.13 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  41.45 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  39.33 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  40 
 
 		 487 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  40.32 
 
 		 488 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  42.3 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  40.63 
 
 		 492 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  38.16 
 
 		 449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  40.63 
 
 		 500 aa  236  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  42.37 
 
 		 469 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  42.91 
 
 		 432 aa  235  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  40.29 
 
 		 515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  38.42 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  39.69 
 
 		 482 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  38.87 
 
 		 476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>