More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0659 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 671 aa  1314    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.4 
 
 		 653 aa  343  7e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.24 
 
 		 720 aa  335  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.22 
 
 		 643 aa  242  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.75 
 
 		 642 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0945  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 		 625 aa  160  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 		 463 aa  147  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.62 
 
 		 745 aa  139  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  22.63 
 
 		 741 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.77 
 
 		 753 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  23.21 
 
 		 734 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 474 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.28 
 
 		 756 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.57 
 
 		 742 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  21.47 
 
 		 753 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 		 804 aa  107  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  23.33 
 
 		 736 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  23.22 
 
 		 803 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  20.1 
 
 		 820 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  21.77 
 
 		 722 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.44 
 
 		 806 aa  99.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  21.9 
 
 		 790 aa  99.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 778 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  18.72 
 
 		 750 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 		 730 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.31 
 
 		 739 aa  96.3  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.7 
 
 		 721 aa  94  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  21.82 
 
 		 779 aa  93.6  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 738 aa  91.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  21.38 
 
 		 727 aa  90.5  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.62 
 
 		 772 aa  90.5  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.35 
 
 		 761 aa  88.6  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  22.59 
 
 		 795 aa  87.8  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  21.81 
 
 		 756 aa  88.2  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0764  protein-tyrosine kinase  21.64 
 
 		 763 aa  87.8  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0280941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  20.55 
 
 		 711 aa  87.4  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  23.21 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.26 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  21.44 
 
 		 727 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  21.07 
 
 		 755 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  23.71 
 
 		 740 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  22.88 
 
 		 775 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  18.16 
 
 		 738 aa  83.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  21.19 
 
 		 743 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.64 
 
 		 730 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  20.09 
 
 		 737 aa  82  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  22.05 
 
 		 727 aa  82.4  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  24.29 
 
 		 739 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  24.29 
 
 		 739 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  20.96 
 
 		 778 aa  81.3  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  22.12 
 
 		 767 aa  81.3  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  24.29 
 
 		 739 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  18.41 
 
 		 736 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.34 
 
 		 720 aa  80.9  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  21.78 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  21.86 
 
 		 772 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  23.52 
 
 		 786 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  23.15 
 
 		 732 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  22.91 
 
 		 740 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  21.25 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  23.82 
 
 		 803 aa  79  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  22.14 
 
 		 731 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  20.38 
 
 		 756 aa  79  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  21.85 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4516  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 		 740 aa  78.2  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265427  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  26.1 
 
 		 800 aa  78.2  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  23.28 
 
 		 740 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  23.2 
 
 		 781 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.01 
 
 		 739 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  21.22 
 
 		 763 aa  77  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  25.44 
 
 		 464 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  22.83 
 
 		 815 aa  77  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  21.55 
 
 		 741 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.55 
 
 		 741 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  21.55 
 
 		 741 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  22.44 
 
 		 794 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  21.54 
 
 		 795 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.37 
 
 		 764 aa  76.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0828  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 726 aa  76.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.490846  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  20.99 
 
 		 797 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0519  capsular exopolysaccharide family  20.79 
 
 		 819 aa  76.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  23.62 
 
 		 755 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2964  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  20.07 
 
 		 741 aa  75.1  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  21.85 
 
 		 746 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  20.77 
 
 		 758 aa  74.7  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.78 
 
 		 741 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  23.64 
 
 		 740 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  21.66 
 
 		 736 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  21.27 
 
 		 741 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.27 
 
 		 741 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 520 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  20.7 
 
 		 741 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  23.84 
 
 		 814 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>