93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1301 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  24.18 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  21.67 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  33.58 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  29.85 
 
 		 187 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  22.88 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  26.25 
 
 		 346 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  28.79 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  29.66 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  30.59 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  27.93 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  23.19 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  22.3 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  27.42 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  35 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3935  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00534901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  28.1 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  39.66 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  22.44 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  31.9 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  53.12 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  25.22 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  22 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 189 aa  42  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 211 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 202 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.36 
 
 		 210 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 202 aa  42  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 185 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>