More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2849 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  36.63 
 
 		 1167 aa  637    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  55.55 
 
 		 1145 aa  1107    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  41.34 
 
 		 1162 aa  751    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  37.38 
 
 		 1164 aa  662    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  37.55 
 
 		 1164 aa  665    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  40.91 
 
 		 1162 aa  751    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  36.49 
 
 		 1165 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  42.11 
 
 		 1162 aa  745    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  53.66 
 
 		 1138 aa  1073    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  53.66 
 
 		 1138 aa  1076    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  53.7 
 
 		 1145 aa  1092    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  58.02 
 
 		 1141 aa  1200    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  41.42 
 
 		 1162 aa  750    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  42.66 
 
 		 1162 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  40 
 
 		 1168 aa  729    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  52.14 
 
 		 1138 aa  991    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  37.54 
 
 		 1167 aa  649    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  41.48 
 
 		 1164 aa  753    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  62.97 
 
 		 814 aa  943    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  40.5 
 
 		 1195 aa  748    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  37.8 
 
 		 1169 aa  687    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  37.49 
 
 		 1169 aa  681    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  42.93 
 
 		 1164 aa  812    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1133 aa  2268    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  54.8 
 
 		 1142 aa  1110    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  55 
 
 		 1142 aa  1115    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  51.38 
 
 		 1144 aa  991    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  42.64 
 
 		 1162 aa  769    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  38.35 
 
 		 1167 aa  677    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  54.01 
 
 		 1138 aa  1082    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  42.55 
 
 		 1162 aa  769    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  55.23 
 
 		 1142 aa  1116    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  54.44 
 
 		 1138 aa  1074    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  40.35 
 
 		 1168 aa  681    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  57.92 
 
 		 1140 aa  1167    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  50.52 
 
 		 1139 aa  1014    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  36.55 
 
 		 1167 aa  635  1e-180  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  37.69 
 
 		 1175 aa  627  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  36.17 
 
 		 1171 aa  618  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  36.17 
 
 		 1174 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  36.17 
 
 		 1174 aa  612  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  36.28 
 
 		 1171 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  35.64 
 
 		 1175 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  36.32 
 
 		 1198 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  35.4 
 
 		 1175 aa  590  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  34.93 
 
 		 1173 aa  588  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  35.91 
 
 		 1190 aa  580  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  36.37 
 
 		 1109 aa  572  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  87.37 
 
 		 299 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.56 
 
 		 1189 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.5 
 
 		 1189 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.48 
 
 		 1189 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.73 
 
 		 1189 aa  429  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  29.5 
 
 		 1187 aa  426  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  43.39 
 
 		 1162 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.12 
 
 		 1186 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  37.87 
 
 		 1163 aa  415  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  42.69 
 
 		 1162 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  43.34 
 
 		 1162 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  31.08 
 
 		 1174 aa  406  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.61 
 
 		 1185 aa  387  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  60.19 
 
 		 1170 aa  385  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  39.43 
 
 		 1168 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  35.69 
 
 		 1164 aa  379  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  68.75 
 
 		 1162 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.69 
 
 		 1170 aa  353  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  27.84 
 
 		 1178 aa  352  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  68.83 
 
 		 1165 aa  330  8e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  50.15 
 
 		 1170 aa  327  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  50.45 
 
 		 1170 aa  327  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  50.45 
 
 		 1170 aa  327  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  50.45 
 
 		 1170 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  50.15 
 
 		 1170 aa  326  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  52.6 
 
 		 1172 aa  327  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  66.97 
 
 		 1170 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  66.52 
 
 		 1170 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  66.52 
 
 		 1170 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  66.52 
 
 		 1170 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  49.85 
 
 		 1206 aa  323  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  66.06 
 
 		 1170 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  37.96 
 
 		 1234 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  66.06 
 
 		 1200 aa  321  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  66.06 
 
 		 1202 aa  321  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  48.5 
 
 		 1171 aa  320  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  66.06 
 
 		 1268 aa  320  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  50.32 
 
 		 1171 aa  318  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.26 
 
 		 1164 aa  318  4e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  33.72 
 
 		 1204 aa  314  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  62.05 
 
 		 1170 aa  311  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  63.8 
 
 		 1171 aa  311  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  62.16 
 
 		 1182 aa  310  6.999999999999999e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  53.45 
 
 		 1167 aa  308  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  63.06 
 
 		 1181 aa  307  8.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  37.25 
 
 		 1142 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  62.16 
 
 		 1171 aa  306  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  40.47 
 
 		 1198 aa  304  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  49.04 
 
 		 1168 aa  304  8.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  57.52 
 
 		 1280 aa  294  7e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  57.14 
 
 		 1307 aa  291  4e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  56.25 
 
 		 1318 aa  285  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>