276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0340 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  100 
 
 		 224 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  53.45 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  47.01 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  44.35 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  44.78 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  44.35 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  40.87 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  37.23 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.71 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  37.05 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  39.39 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  36.12 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  36.32 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  35.24 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  34.05 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  33.19 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  35.35 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  33.63 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  34.96 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  34.07 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  33.92 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  34.07 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  34.05 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  30.7 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  32.44 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  32.3 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  35.5 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  33.03 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  34.39 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.15 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  32.61 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  32.61 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.77 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  32.33 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  30.97 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  32.44 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.56 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  30.87 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  31.9 
 
 		 220 aa  105  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.62 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  28.07 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  28.77 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  33.78 
 
 		 216 aa  99  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  31.25 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  28.95 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  31.96 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  31.65 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  29.86 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  30.7 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  30.7 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  30.09 
 
 		 215 aa  88.6  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  32.46 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  27.85 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.91 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  31.28 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  22.96 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  31.66 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  27.01 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  31.22 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  30.33 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  35.15 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  24.32 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  25.26 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  33.59 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  30.29 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  30.05 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  28.84 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  29.47 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  24.48 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  25.68 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  28.57 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  27.67 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  23.87 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  26.96 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.37 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  26.67 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  25.37 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  26 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  26.74 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  24.76 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3625  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.32 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0761  endonuclease III  25.93 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169913  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  27.72 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  27.72 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  27.97 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  25.35 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  23.88 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  29.5 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.05 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  25.59 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  24.4 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  26.06 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.65 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0115  endonuclease III  27.56 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.78 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  25.13 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  24.38 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  27.97 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>