More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0522 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  100 
 
 
216 aa  435  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  61.03 
 
 
220 aa  263  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  60.56 
 
 
220 aa  262  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  57.21 
 
 
225 aa  236  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  47.27 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  46.86 
 
 
223 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  45.5 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  44.61 
 
 
216 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  46.3 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  44.65 
 
 
228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  47.03 
 
 
206 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  44.71 
 
 
228 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  43.93 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  41.1 
 
 
223 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  46.08 
 
 
225 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  38.25 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  45.75 
 
 
223 aa  162  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  42.13 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  42.18 
 
 
226 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  44.34 
 
 
232 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  40.28 
 
 
217 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  39.63 
 
 
220 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  42.47 
 
 
222 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  41.86 
 
 
225 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  45.28 
 
 
224 aa  154  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  38.25 
 
 
223 aa  154  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  38.25 
 
 
223 aa  154  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  42.99 
 
 
232 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  42.44 
 
 
218 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  38.01 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  40.86 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  38.25 
 
 
250 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  48.09 
 
 
232 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  40.2 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  47.8 
 
 
232 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  47.54 
 
 
232 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.21 
 
 
221 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.14 
 
 
257 aa  138  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.32 
 
 
254 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  38.05 
 
 
226 aa  134  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  39.27 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  37.75 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.58 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  39.3 
 
 
232 aa  125  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  36 
 
 
215 aa  122  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  39.61 
 
 
216 aa  121  8e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  40.1 
 
 
216 aa  116  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  37.39 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  34.87 
 
 
227 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  31.92 
 
 
268 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  38.74 
 
 
222 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  37.63 
 
 
222 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  31.98 
 
 
216 aa  106  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  31.98 
 
 
211 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  38.54 
 
 
226 aa  104  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  32.84 
 
 
211 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  32.84 
 
 
211 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  38.22 
 
 
228 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  36.82 
 
 
221 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  37.57 
 
 
228 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.78 
 
 
224 aa  99  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  37.57 
 
 
228 aa  98.2  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  33.33 
 
 
219 aa  96.7  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  36.08 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  34.24 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  29.95 
 
 
233 aa  89.4  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  27.12 
 
 
297 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  29.84 
 
 
213 aa  89  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  29.84 
 
 
213 aa  89  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.26 
 
 
221 aa  88.6  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.31 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  28.29 
 
 
210 aa  85.1  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  25.96 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.27 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  28.71 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  31.96 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  27.94 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  28.72 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  29.63 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  30.61 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  31.77 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.42 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  27.31 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.74 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  29.19 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  25.4 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  29.19 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  26.47 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.21 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.26 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  33.33 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.22 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.6 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  27.27 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.66 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  29.47 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  26.09 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  29.02 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  27.7 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  29.73 
 
 
251 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>