More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1583 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  100 
 
 		 221 aa  459  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  45.83 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  38.29 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  35.08 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  31.47 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  32.24 
 
 		 213 aa  108  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.93 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.05 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  33.68 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  35.6 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  30.93 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  36.41 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  34.36 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  32.66 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  32.64 
 
 		 216 aa  98.6  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  31.63 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  31.82 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  32.84 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  32.98 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  31.77 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  32.12 
 
 		 221 aa  94.7  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  30.81 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  32.5 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  31.28 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  32.8 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  31.63 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  30.84 
 
 		 268 aa  92  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.1 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  32.2 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  33.16 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  31.02 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  30.2 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  31.55 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  31.55 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  27.69 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  29.38 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  29.38 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  29.02 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  33.58 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.3 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  29.9 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  30.46 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  28.5 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  27.68 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.73 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  31.03 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  28.81 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.81 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.22 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  26.15 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  33.88 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  31.1 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  29.27 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  30.23 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  26.09 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.94 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  30.94 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  27.64 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  26.55 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  27.4 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  27.94 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  28.93 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  27.54 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  27.54 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  25.79 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.11 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  34.33 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  26.92 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  26.04 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  28.57 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  31.28 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  28.57 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.87 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.7 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  27.23 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  28.03 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  27.45 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  29.22 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  26.97 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  24.88 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  25.49 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0516  endonuclease III/Nth  26.17 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  25.52 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  28.99 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  27.27 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  25 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  24.86 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  25.91 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  28.21 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  23 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2465  endonuclease III  24.87 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  27.39 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  26.45 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.4 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  26.4 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  27.39 
 
 		 335 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>