282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0080 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  66.97 
 
 		 222 aa  313  9e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  57.28 
 
 		 216 aa  228  4e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  50.89 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  45.58 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  46.02 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  46.02 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  42.29 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  44.56 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  41.44 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  40.82 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  40.53 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  38.86 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  41.88 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  37.97 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  39.15 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  37.32 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  34.58 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.22 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  37.04 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  36.36 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  35.42 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  35.42 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  35.6 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  40.84 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  36.96 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  36.84 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  34.9 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  35.57 
 
 		 220 aa  114  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  37.97 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  40.53 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  37.43 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  36.41 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  35.58 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  38.3 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  42.22 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  40.82 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  38.74 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  36.13 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.64 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  35.98 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  35.52 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  36.31 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  35.2 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  35.03 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.75 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  31.75 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  33.16 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.24 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.38 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  30.85 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  30.85 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  27.75 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  36.69 
 
 		 297 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  41.09 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  38.76 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  35.15 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  33.52 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  30.11 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  30.24 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  32.93 
 
 		 296 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  32.8 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  36.84 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  31.41 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.93 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  34.17 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  32.37 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.29 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  27.62 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  33.06 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  32.88 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  27.12 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  29.17 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.49 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  28.41 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  34.38 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.45 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  31.62 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.93 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.26 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.15 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.03 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.84 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.94 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  27.84 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.31 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  31.08 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.11 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.08 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.67 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  30.58 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  31.3 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  30 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.97 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.44 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  28.46 
 
 		 276 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.51 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  29.08 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  31.97 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>