More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1273 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 215 aa  433  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.67 
 
 		 219 aa  251  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.12 
 
 		 219 aa  247  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  52.15 
 
 		 218 aa  244  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1450  endonuclease III, putative  54.04 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  56.52 
 
 		 220 aa  242  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  55.12 
 
 		 218 aa  242  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.77 
 
 		 220 aa  242  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.92 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.68 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.41 
 
 		 220 aa  236  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.42 
 
 		 220 aa  234  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.67 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.04 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  58.01 
 
 		 203 aa  214  9e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  54.24 
 
 		 204 aa  204  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  54.8 
 
 		 213 aa  201  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  54.8 
 
 		 213 aa  201  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.33 
 
 		 356 aa  198  6e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.87 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  55.11 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.26 
 
 		 356 aa  190  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.26 
 
 		 356 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  50.26 
 
 		 356 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.41 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.6 
 
 		 357 aa  178  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.84 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  49.15 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  46.53 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.41 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  45.56 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.56 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  42.06 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.72 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  42.08 
 
 		 260 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  43.82 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  45 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  45 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  40.98 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.99 
 
 		 210 aa  157  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  40.88 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.44 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0857  endonuclease III  42.86 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  43.09 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  41.99 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  41.44 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  39.56 
 
 		 248 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  40.98 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4204  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.2 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  41.55 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  39.01 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  42.46 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43577  predicted protein  40.44 
 
 		 273 aa  154  8e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00140419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  40.88 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  40.88 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  40.88 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  40.88 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  40.88 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  40.88 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  40.88 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  41.53 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  40.88 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  39.89 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  40.33 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  41.44 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  39.89 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  40.98 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  40.56 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  38.67 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  41.76 
 
 		 254 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.11 
 
 		 268 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  38.76 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  43.17 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  39.78 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  40.88 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.33 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  39.34 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  38.33 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  43.65 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  42.37 
 
 		 208 aa  152  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  37.75 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  43.78 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  38.33 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  38.46 
 
 		 249 aa  151  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  40.54 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0235  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.86 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.784957  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  40.86 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  38.8 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.98 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  40.33 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  41.44 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  38.8 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1562  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  39.44 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  40.33 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.44 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  39.77 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2824  endonuclease III  39.44 
 
 		 250 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  40.44 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  42.16 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  39.34 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>