More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0663 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  63.76 
 
 		 218 aa  290  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.93 
 
 		 218 aa  289  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  62.39 
 
 		 218 aa  288  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  61.36 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.91 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1450  endonuclease III, putative  61.24 
 
 		 209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.45 
 
 		 219 aa  260  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.14 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.93 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.15 
 
 		 215 aa  244  6e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.66 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.87 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.39 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.45 
 
 		 356 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  47.28 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  45.75 
 
 		 204 aa  188  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  187  9e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 		 356 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.26 
 
 		 356 aa  184  6e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.16 
 
 		 357 aa  184  9e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  46.41 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  46.93 
 
 		 213 aa  177  9e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  46.93 
 
 		 213 aa  177  9e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.76 
 
 		 211 aa  177  9e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  45 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.5 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4204  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.26 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.17 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  34.86 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43577  predicted protein  40.98 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00140419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.56 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  40.11 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  36.89 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  38.2 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  39.46 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  36.52 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  38.62 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  35.12 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  37.84 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.1 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  38.64 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  40.45 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  37.5 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.02 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  37.29 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  34.15 
 
 		 209 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  34.13 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  39.57 
 
 		 268 aa  134  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  36.93 
 
 		 258 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.77 
 
 		 258 aa  134  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  37.44 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.64 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  36.16 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  36.57 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  36.93 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  37.02 
 
 		 285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  33.96 
 
 		 237 aa  132  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  36 
 
 		 260 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  37.1 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.23 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  36.46 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.29 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  38.3 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  36.78 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  36.17 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  40.11 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  35.8 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.28 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  36.96 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  36.36 
 
 		 252 aa  128  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  35.03 
 
 		 260 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  35.89 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  35.89 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36 
 
 		 268 aa  128  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  37.04 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  34.66 
 
 		 260 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  32.47 
 
 		 211 aa  128  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  35.43 
 
 		 249 aa  127  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2534  endonuclease III  35.8 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0635036  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.29 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  35.71 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  35.98 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  33.66 
 
 		 262 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  34.43 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  35.87 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  35.07 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  35.06 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.39 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  34.66 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.81 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  37.78 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  33.51 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  35.56 
 
 		 259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0761  endonuclease III  33.81 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  35.64 
 
 		 284 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  34.78 
 
 		 210 aa  125  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  35.59 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  32.04 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  37.85 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>