270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1638 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 204 aa  424  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  38.86 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  35.94 
 
 		 211 aa  127  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  34.69 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  35.94 
 
 		 228 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  38.42 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  37.31 
 
 		 223 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.79 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  36.46 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  40.25 
 
 		 220 aa  111  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  37.84 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.04 
 
 		 257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  35.42 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  37.3 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  36.13 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  35.42 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  37.57 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  33.85 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  36.61 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 220 aa  104  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  34.03 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  36.93 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  33.68 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  35.79 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  34.85 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  33.16 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  34.85 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  33.5 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  29.95 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  32.43 
 
 		 232 aa  98.6  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  35 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  31.84 
 
 		 232 aa  95.9  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  36.42 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  34.39 
 
 		 226 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  37.58 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  36.08 
 
 		 216 aa  95.5  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  33.68 
 
 		 224 aa  93.2  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  35 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.84 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.65 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  33.56 
 
 		 226 aa  92  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.27 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  33.73 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.17 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  38.57 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  38.89 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.53 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  32.31 
 
 		 232 aa  85.1  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  32.72 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  28.49 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  30.65 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  32 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  32.17 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.57 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  34.42 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  36.43 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  30.94 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  32.4 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  35.82 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  27.5 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  31.28 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  35.29 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  30.81 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  30.6 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  30.82 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  34.17 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.6 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  31.82 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  31.34 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  30 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  28.28 
 
 		 269 aa  68.2  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  27.75 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  28.5 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.1 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.29 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.36 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2500  endonuclease III  28.32 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666144  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  28.66 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.21 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  26.18 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  28.57 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  29.82 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  32.86 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  28.19 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  26.51 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.74 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  28.77 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  27.74 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  28.22 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  26.59 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.77 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  32.28 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  26.38 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000630803  hitchhiker  0.000000662064 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  28.74 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  28.74 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  29.09 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  28.81 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  25.16 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>