More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1388 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  64.56 
 
 		 213 aa  290  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  64.56 
 
 		 213 aa  290  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  66.5 
 
 		 221 aa  286  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  64.92 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  49.75 
 
 		 204 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.58 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.11 
 
 		 204 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.11 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1450  endonuclease III, putative  45.26 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.76 
 
 		 211 aa  191  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.23 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.91 
 
 		 356 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.83 
 
 		 356 aa  186  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.35 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  45.32 
 
 		 356 aa  184  7e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  46.41 
 
 		 218 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.91 
 
 		 356 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.86 
 
 		 227 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.86 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  45.31 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.16 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.86 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.21 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  39.41 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.63 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.36 
 
 		 357 aa  176  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.58 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  42.11 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  38.92 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  43.63 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  40.11 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  40.56 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  43.48 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  42.33 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  34.48 
 
 		 220 aa  154  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  32.85 
 
 		 246 aa  154  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  37.08 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  42.94 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  40.34 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  37.19 
 
 		 260 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.66 
 
 		 263 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  35.9 
 
 		 219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.47 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  36.5 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  33.68 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  40.59 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.16 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  39.6 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  35.68 
 
 		 260 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  39.2 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  32.23 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  39.06 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  36.87 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  34.87 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  30.92 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  34.13 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  33.68 
 
 		 239 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.37 
 
 		 277 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  38.14 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  38.14 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.35 
 
 		 178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  37.78 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  33.85 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  38.66 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  39.59 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  33.16 
 
 		 246 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  35.14 
 
 		 222 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.36 
 
 		 216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  40.23 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  40.23 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  38.66 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  37.63 
 
 		 215 aa  143  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  36.61 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  37.16 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  36.98 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1222  endonuclease III  40.45 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.67 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  38.59 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  36.61 
 
 		 260 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  34.33 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  34.5 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  38.14 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  38.14 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  38.14 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  33.8 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  38.14 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  38.14 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  38.14 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  37.11 
 
 		 209 aa  141  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  33.16 
 
 		 244 aa  141  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  38.3 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  34.27 
 
 		 281 aa  141  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  30.43 
 
 		 238 aa  141  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  36.5 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  34.9 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.86 
 
 		 243 aa  141  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  32.69 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.14 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  38.25 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>