167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1611 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 221 aa  457  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  50.23 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  47.8 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  46.6 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  44.56 
 
 		 222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  40 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  41.75 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  41.24 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  39.69 
 
 		 228 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  34.87 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  34.47 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  35.94 
 
 		 228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  34.85 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  34.83 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  32 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.07 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  40.13 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  36.14 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  36.74 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  35.1 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  33.68 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  32.62 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  35.15 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  36.17 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  32.49 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  30.65 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.43 
 
 		 237 aa  101  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  36.82 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  32.84 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  37.06 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  35.53 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  35.53 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.84 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  41.18 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  34.34 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  32.38 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  36.22 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.54 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  32.51 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  32.29 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  36.65 
 
 		 217 aa  95.9  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  33.16 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  32.99 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  33.66 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  28.43 
 
 		 296 aa  92  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  32.64 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  27.94 
 
 		 297 aa  91.3  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  32.23 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  31.98 
 
 		 223 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  32.8 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  33.12 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.85 
 
 		 254 aa  85.1  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  34.27 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  31.86 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.8 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  30.89 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  36.43 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.58 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  30.95 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  28.72 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.22 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  26.5 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  29.95 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  29.02 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  32.19 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  32.19 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  27.98 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  29.35 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  26.11 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.92 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  23.32 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.21 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.71 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  26.47 
 
 		 356 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  26.88 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  30.17 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.47 
 
 		 356 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  22.54 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.25 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  22.28 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  28.47 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.68 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.6 
 
 		 356 aa  49.3  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0246  endonuclease III  22.63 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00760265  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3917  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  34.78 
 
 		 352 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  34.78 
 
 		 352 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  25.93 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.62 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.58 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  27.82 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  25.55 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.83 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  24.09 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  23.53 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3625  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  24.03 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  23.91 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  23.19 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>