More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0533 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  97.27 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  60.56 
 
 		 216 aa  262  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  57.28 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  47.17 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  46.51 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  46.92 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  47.39 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  44.98 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  43.89 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  44.81 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  41.78 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  44.29 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  45.54 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  44.23 
 
 		 232 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  45.37 
 
 		 206 aa  167  9e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  41.31 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  44.5 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  42.65 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  41.31 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  41.51 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  46.51 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  45.24 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  43.84 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  43.84 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  45.5 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  38.81 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.51 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.82 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  44.83 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  45.02 
 
 		 232 aa  157  9e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  39.82 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  40.09 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  38.76 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  42.18 
 
 		 234 aa  148  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  40.76 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  37.62 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  42.06 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.38 
 
 		 229 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  37.71 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.39 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  38.24 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  38.73 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  34.58 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  37.75 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  36.36 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.9 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  36.02 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  33.2 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  36.89 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  32.9 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  33.85 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  38.12 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.97 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  38.25 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  35 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  37.57 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  31.34 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  31.34 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.33 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  33.85 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  35.9 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  34.59 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  30.64 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  33.01 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  34.02 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  35.71 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  34.02 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  31.35 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  29.36 
 
 		 297 aa  98.6  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  33.67 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  36.22 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.83 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  28.92 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.5 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.63 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  28.65 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.65 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3917  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.1 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3625  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.1 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  28.17 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  28.24 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.53 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  27.4 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  27.17 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  26.98 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  28.8 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.89 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  27.66 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.89 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  27.51 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.05 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.2 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  25.65 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  26.74 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  27.66 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  27.51 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.39 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.21 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  26.13 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>