More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3156 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  63.68 
 
 		 226 aa  288  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  62.5 
 
 		 232 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  56.48 
 
 		 221 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  51.63 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  46.64 
 
 		 222 aa  205  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  50.24 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  49.07 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  50 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  49.53 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  50.23 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  43.4 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  50.23 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  49.77 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  46.7 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  53.4 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  43.66 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  40.55 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  44.71 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  43.54 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  45.75 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  49.23 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  41.75 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  45.37 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  47.44 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  43.19 
 
 		 250 aa  174  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  46.34 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  48.99 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  45.54 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  45.07 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  42.23 
 
 		 226 aa  167  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  47.98 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  39.25 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  40.1 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  41.1 
 
 		 216 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  40.87 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  34.44 
 
 		 232 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.64 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.86 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.37 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  32.78 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.41 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  33.5 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  31.12 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  38.25 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  37.96 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  33.33 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  38.46 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  35.11 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  34.72 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  30.85 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  30.85 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  34.32 
 
 		 297 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  35.42 
 
 		 296 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  37.56 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  36.96 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  36.13 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  30.97 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.73 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  35.64 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  36.61 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  32.51 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  34.59 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.87 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.05 
 
 		 240 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  32.81 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  34.01 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.9 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.49 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  31.98 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  27.69 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  31.09 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  32.63 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  28.65 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  39.39 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  31.98 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  32.46 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  31.38 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  30.85 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.1 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.51 
 
 		 221 aa  85.1  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  30.65 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  31.02 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  30.62 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.55 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.41 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.93 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.57 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  27.07 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  28.57 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.45 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  30.95 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  26.73 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.03 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  30.26 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  29.73 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.08 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.2 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.29 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  30.58 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>