250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0834 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  40.3 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  37.56 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  36.89 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  36.59 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  36.59 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.8 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  41.15 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  36.79 
 
 		 223 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  40 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  41.15 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  38.86 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  42.33 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  37.81 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  42.95 
 
 		 226 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  39.39 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.01 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  37 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  39.3 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  39.3 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  38.97 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  35.42 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  36.65 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  40.93 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  37.56 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  38.46 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  37.63 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  36.73 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.45 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  37.24 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  39.51 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  30.95 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  37.31 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  39.87 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  30.57 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  35.96 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  30.43 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  29.69 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  34.03 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  36.1 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  30.21 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.82 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  35.71 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  27.6 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  32.52 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  27.93 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  33.01 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.77 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  34.92 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  34.57 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  29.28 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  31.34 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  33.86 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  26.58 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.47 
 
 		 254 aa  96.3  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  30.73 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  39.31 
 
 		 297 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  34.39 
 
 		 296 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  34.45 
 
 		 268 aa  91.3  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  30.11 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  26.5 
 
 		 243 aa  85.5  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  28.42 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  32.35 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  32.33 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  29.12 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  29.95 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.62 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  28.93 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  28.47 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  27.97 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.09 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.3 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  28.17 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  28.65 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  31.54 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  31.54 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  29.85 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  29.77 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  27.74 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  34.59 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  31.06 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  28.03 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.21 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  29.85 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.16 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  30.99 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  27.23 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  26.32 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  29.1 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3917  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.61 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  27.69 
 
 		 356 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  26.97 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  26.12 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.35 
 
 		 356 aa  52  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.57 
 
 		 270 aa  52  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  28.46 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  27.03 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  27.27 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  28.57 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>