More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_10790 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  100 
 
 
212 aa  441  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  52.53 
 
 
208 aa  232  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  53.03 
 
 
211 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  57.14 
 
 
197 aa  229  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  55 
 
 
213 aa  224  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  51.53 
 
 
219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  50 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  52.58 
 
 
212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.49 
 
 
212 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.48 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.77 
 
 
214 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  49.5 
 
 
214 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  48.47 
 
 
207 aa  209  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  49 
 
 
214 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  48.26 
 
 
209 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  46.31 
 
 
220 aa  208  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.31 
 
 
214 aa  208  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  48.28 
 
 
236 aa  208  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  48.53 
 
 
212 aa  207  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  52 
 
 
218 aa  207  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  48.78 
 
 
260 aa  207  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  47.76 
 
 
209 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  47.8 
 
 
212 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  48.02 
 
 
215 aa  206  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  52.88 
 
 
215 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  47.8 
 
 
212 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  48.78 
 
 
260 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  50.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  50.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  50.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  50.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  50.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  50.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.04 
 
 
212 aa  205  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  50.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  49.27 
 
 
212 aa  204  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  47.06 
 
 
212 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  48.54 
 
 
248 aa  204  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.76 
 
 
231 aa  204  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  47.55 
 
 
212 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  48.78 
 
 
236 aa  204  9e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1562  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.83 
 
 
226 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.888667 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  49.01 
 
 
211 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  49.01 
 
 
211 aa  203  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.53 
 
 
229 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  48.06 
 
 
260 aa  203  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  47.55 
 
 
212 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  50.26 
 
 
214 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  50.26 
 
 
219 aa  202  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  46.6 
 
 
236 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  47.78 
 
 
212 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2079  endonuclease III  50.79 
 
 
214 aa  201  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.29657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.31 
 
 
212 aa  201  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  46.31 
 
 
212 aa  201  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  47.06 
 
 
212 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  47.32 
 
 
214 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.8 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  46.77 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  45.59 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  45.37 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  46.91 
 
 
211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  48.69 
 
 
217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  47.76 
 
 
230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  44.93 
 
 
220 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  50.79 
 
 
215 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2824  endonuclease III  50.79 
 
 
250 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.105195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  49.21 
 
 
214 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  47.09 
 
 
249 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  49.74 
 
 
226 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  49.21 
 
 
214 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.98 
 
 
213 aa  198  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  49.21 
 
 
214 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  49.21 
 
 
214 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  46.57 
 
 
212 aa  197  9e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  47.29 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  48.69 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  48.96 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  47.06 
 
 
335 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  45.45 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  47.29 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  50 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  50.24 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.21 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.21 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  46.31 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  48.69 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  49.21 
 
 
216 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.26 
 
 
211 aa  196  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  47.24 
 
 
218 aa  194  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  47.24 
 
 
218 aa  194  6e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  47.32 
 
 
211 aa  194  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  47.52 
 
 
213 aa  194  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  53.37 
 
 
215 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.21 
 
 
214 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.6 
 
 
268 aa  194  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  48.69 
 
 
214 aa  193  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2072  endonuclease III  46.04 
 
 
213 aa  193  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  48.26 
 
 
210 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  50.49 
 
 
223 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.44 
 
 
258 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>