More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0510 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  100 
 
 		 223 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  87.89 
 
 		 223 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  81.69 
 
 		 215 aa  377  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  81.4 
 
 		 215 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  81.4 
 
 		 215 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  81.4 
 
 		 215 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  81.4 
 
 		 215 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  81.4 
 
 		 215 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  81.4 
 
 		 215 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  80.47 
 
 		 215 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  79.81 
 
 		 215 aa  371  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  80.28 
 
 		 215 aa  370  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  78.6 
 
 		 215 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  61.64 
 
 		 219 aa  290  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  63.38 
 
 		 219 aa  290  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  63.38 
 
 		 219 aa  290  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  51.4 
 
 		 214 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.7 
 
 		 218 aa  225  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  50.95 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  51.74 
 
 		 208 aa  214  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.89 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  54.4 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  47.12 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.97 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  50.5 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  49.75 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  53.61 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  48.29 
 
 		 218 aa  205  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0468  endonuclease III  50.74 
 
 		 210 aa  204  8e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  50 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  49.5 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  49.01 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  49.01 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  53.48 
 
 		 215 aa  201  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  51.56 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  49.76 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.75 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  51.01 
 
 		 213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.75 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  50 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  51.83 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  50 
 
 		 257 aa  194  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  48.96 
 
 		 238 aa  194  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  52.11 
 
 		 197 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  49.02 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  50.26 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  47.06 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.06 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  50.49 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  46.88 
 
 		 276 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  48.96 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  51.1 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  51.87 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  49.27 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  50.25 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  52.41 
 
 		 215 aa  192  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  48.78 
 
 		 260 aa  191  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.85 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  45.79 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  45.6 
 
 		 251 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  49.03 
 
 		 252 aa  189  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  45.97 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.81 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  46.12 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  48.48 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.34 
 
 		 213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  51.34 
 
 		 213 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  47.76 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  47.09 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  47.92 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  44.7 
 
 		 219 aa  187  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.8 
 
 		 213 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  49.49 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  48.53 
 
 		 256 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  49.49 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  49.49 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  41.59 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  50.27 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  50.26 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.02 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  47.8 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  43.41 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  45.5 
 
 		 211 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  48.99 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  47.87 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  44.33 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  51.34 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2174  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.8 
 
 		 211 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  44.33 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  50.27 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  49.22 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  46.05 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  47.06 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.06 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  50.8 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  47.06 
 
 		 254 aa  185  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  46.88 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  50.27 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>