More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1681 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  100 
 
 
212 aa  440  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  71.23 
 
 
212 aa  313  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  67.45 
 
 
212 aa  307  9e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  70.24 
 
 
208 aa  300  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  66.98 
 
 
216 aa  297  8e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  66.02 
 
 
211 aa  288  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  62.8 
 
 
220 aa  279  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.42 
 
 
219 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.96 
 
 
212 aa  222  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  49.76 
 
 
212 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  49.76 
 
 
212 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  51.83 
 
 
212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  49.76 
 
 
335 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  52.36 
 
 
212 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  48.08 
 
 
212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  52.08 
 
 
215 aa  217  8.999999999999998e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  50.99 
 
 
213 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  48.56 
 
 
212 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.72 
 
 
237 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  50 
 
 
213 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  48.56 
 
 
212 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  51.56 
 
 
219 aa  214  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.56 
 
 
219 aa  214  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  49.76 
 
 
211 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.08 
 
 
212 aa  214  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  48.06 
 
 
212 aa  214  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  49.76 
 
 
213 aa  214  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.49 
 
 
210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  51.31 
 
 
212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  52.58 
 
 
212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  50 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  52.36 
 
 
211 aa  211  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  52.36 
 
 
211 aa  211  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  52.36 
 
 
211 aa  211  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  52.36 
 
 
211 aa  211  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  52.36 
 
 
211 aa  211  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  50.79 
 
 
211 aa  211  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  52.36 
 
 
211 aa  211  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  52.36 
 
 
211 aa  211  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  52.36 
 
 
211 aa  211  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  48.78 
 
 
213 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  51.83 
 
 
211 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  51.83 
 
 
211 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  51.83 
 
 
211 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  51.83 
 
 
211 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  51.83 
 
 
211 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  50.26 
 
 
213 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  51.79 
 
 
214 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  51.79 
 
 
214 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  50.26 
 
 
213 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  51.79 
 
 
214 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  51.79 
 
 
214 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  51.79 
 
 
214 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  51.79 
 
 
214 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  50.26 
 
 
213 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.32 
 
 
212 aa  209  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  51.79 
 
 
214 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  51.52 
 
 
219 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  50.79 
 
 
213 aa  209  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.03 
 
 
211 aa  209  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  50.26 
 
 
211 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  51.83 
 
 
211 aa  208  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.97 
 
 
212 aa  208  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1074  endonuclease III  49.51 
 
 
235 aa  208  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  50.26 
 
 
213 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.79 
 
 
213 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  51.01 
 
 
214 aa  207  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  51.06 
 
 
231 aa  207  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  52.36 
 
 
230 aa  207  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  50.51 
 
 
213 aa  207  9e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  49.74 
 
 
213 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  50.26 
 
 
211 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.26 
 
 
213 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  50.76 
 
 
214 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  50.79 
 
 
211 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  50.51 
 
 
211 aa  206  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  49.74 
 
 
210 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  48.54 
 
 
210 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.25 
 
 
214 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2072  endonuclease III  48.48 
 
 
213 aa  205  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  48.04 
 
 
215 aa  204  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2174  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50 
 
 
211 aa  204  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660077  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  47.83 
 
 
213 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  47.03 
 
 
217 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0851  endonuclease III  49.49 
 
 
231 aa  203  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2971  endonuclease III  46.6 
 
 
210 aa  203  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  50.26 
 
 
214 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.57 
 
 
211 aa  203  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  45.97 
 
 
218 aa  203  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  51.83 
 
 
287 aa  202  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  45.97 
 
 
218 aa  203  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  50.26 
 
 
214 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2234  endonuclease III  49.21 
 
 
213 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000219145 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  50.26 
 
 
214 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  50.26 
 
 
214 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.02 
 
 
214 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.26 
 
 
214 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  49.49 
 
 
249 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  48.17 
 
 
213 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  48.17 
 
 
213 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>