More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0416 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  100 
 
 		 208 aa  433  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  75 
 
 		 212 aa  313  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  70.24 
 
 		 212 aa  300  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  70.53 
 
 		 216 aa  298  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  69.27 
 
 		 212 aa  290  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  67.49 
 
 		 220 aa  288  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  65.53 
 
 		 211 aa  280  8.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  51.46 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  54.36 
 
 		 237 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.48 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  51.81 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.26 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  51.47 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50 
 
 		 211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  51.28 
 
 		 248 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  50.49 
 
 		 214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  51.01 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  51.01 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  51.01 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  51.01 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  51.01 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  51.01 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  51.01 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  49.51 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  50.77 
 
 		 249 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  50.97 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.97 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  53.76 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  51.01 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  49.23 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  49.49 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.49 
 
 		 214 aa  208  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  51.3 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  50.77 
 
 		 212 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  49.27 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  46.34 
 
 		 212 aa  207  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  47.6 
 
 		 211 aa  207  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  50 
 
 		 214 aa  207  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  50.77 
 
 		 254 aa  207  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.26 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  50 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.79 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.72 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  50 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.72 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2234  endonuclease III  47.12 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.32 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  49.22 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  49.49 
 
 		 214 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  49.49 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.25 
 
 		 214 aa  205  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  46.63 
 
 		 211 aa  205  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  51.3 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  49.49 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  49.76 
 
 		 211 aa  205  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  49.49 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.67 
 
 		 212 aa  205  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.49 
 
 		 214 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  48.29 
 
 		 211 aa  204  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  50 
 
 		 226 aa  204  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  48.21 
 
 		 211 aa  204  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  52.13 
 
 		 270 aa  204  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.83 
 
 		 213 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.3 
 
 		 212 aa  204  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  49.23 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  50.78 
 
 		 260 aa  204  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  46.34 
 
 		 213 aa  204  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  46.34 
 
 		 213 aa  204  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  49.49 
 
 		 214 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  50 
 
 		 225 aa  204  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  46.8 
 
 		 213 aa  204  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  52.13 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  46.34 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  47.12 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  49.5 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  46.34 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  49.74 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  46.34 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  48.79 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  48.72 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  48.72 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  48.72 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  50.75 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  46.6 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  46.34 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  48.21 
 
 		 211 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  48.21 
 
 		 211 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  48.72 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  50.53 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  50.53 
 
 		 236 aa  202  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  48.72 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  48.72 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  48.72 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  48.72 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  48.21 
 
 		 211 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  48.21 
 
 		 211 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  48.21 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  48.5 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  48.21 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.74 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>