More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0532 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  87.79 
 
 		 213 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  89.27 
 
 		 217 aa  384  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  83.96 
 
 		 213 aa  377  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  85.38 
 
 		 213 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  85.38 
 
 		 213 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  85.38 
 
 		 213 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  86.12 
 
 		 211 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  86.12 
 
 		 211 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  86.12 
 
 		 211 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  85.17 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  85.17 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  85.17 
 
 		 211 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  85.17 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  84.76 
 
 		 211 aa  370  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  84.69 
 
 		 211 aa  370  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  85.17 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  85.65 
 
 		 211 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  85.17 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  85.17 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  85.17 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  85.17 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  85.17 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  85.17 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  81.9 
 
 		 211 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2234  endonuclease III  83.57 
 
 		 213 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  84.13 
 
 		 211 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  83.17 
 
 		 211 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  83.02 
 
 		 213 aa  367  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2178  endonuclease III  81.13 
 
 		 213 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.468625  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2072  endonuclease III  82.08 
 
 		 213 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  82.08 
 
 		 213 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  83.17 
 
 		 210 aa  364  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  81.13 
 
 		 213 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  81.13 
 
 		 213 aa  363  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  81.6 
 
 		 213 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  80.66 
 
 		 213 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  80.66 
 
 		 213 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  80.66 
 
 		 213 aa  362  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  80.19 
 
 		 212 aa  362  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  80.66 
 
 		 212 aa  361  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  80.19 
 
 		 213 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2971  endonuclease III  80.38 
 
 		 210 aa  354  5.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  79.71 
 
 		 231 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  80.77 
 
 		 211 aa  350  7e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2174  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  80.49 
 
 		 211 aa  349  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  79.81 
 
 		 211 aa  348  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  77.88 
 
 		 212 aa  337  9e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  74.16 
 
 		 212 aa  330  7.000000000000001e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  73.71 
 
 		 225 aa  330  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1539  endonuclease III  76.92 
 
 		 211 aa  327  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  72.99 
 
 		 211 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2193  endonuclease III  71.1 
 
 		 220 aa  323  9e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  74.04 
 
 		 212 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  72.6 
 
 		 212 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  73.08 
 
 		 212 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  71.56 
 
 		 215 aa  316  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  72.6 
 
 		 212 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  73.08 
 
 		 212 aa  315  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  72.12 
 
 		 212 aa  314  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  73.08 
 
 		 212 aa  313  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  72.12 
 
 		 212 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  70.67 
 
 		 212 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  70.67 
 
 		 212 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  70.42 
 
 		 230 aa  310  6.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  70.19 
 
 		 211 aa  310  7.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  70.33 
 
 		 219 aa  310  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  69.71 
 
 		 211 aa  308  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  70.19 
 
 		 210 aa  308  4e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  69.86 
 
 		 335 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  71.15 
 
 		 226 aa  306  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  71.15 
 
 		 214 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  71.08 
 
 		 236 aa  304  7e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  68.27 
 
 		 210 aa  300  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  69.38 
 
 		 214 aa  299  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  69.38 
 
 		 214 aa  299  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  69.38 
 
 		 214 aa  298  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  67.14 
 
 		 236 aa  298  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  65.73 
 
 		 215 aa  298  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  69.38 
 
 		 214 aa  298  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  67.94 
 
 		 213 aa  297  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  68.25 
 
 		 214 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  67.77 
 
 		 214 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  67.31 
 
 		 228 aa  295  4e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  67.3 
 
 		 214 aa  294  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  67.3 
 
 		 214 aa  294  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  70.19 
 
 		 214 aa  293  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  66.83 
 
 		 228 aa  293  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  67.3 
 
 		 214 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  67.3 
 
 		 214 aa  293  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  67.3 
 
 		 214 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  66.35 
 
 		 214 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  66.2 
 
 		 219 aa  289  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  66.2 
 
 		 219 aa  289  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  66.35 
 
 		 214 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  63.85 
 
 		 229 aa  285  5e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  66.35 
 
 		 214 aa  284  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  65.87 
 
 		 214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  65.87 
 
 		 214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  65.87 
 
 		 214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>